中国科学院生态环境研究中心张昱、杨敏等WR：长读长宏基因组揭示斯里兰卡医院污水中临床重要耐药基因的流...

正文

请到「今天看啥」查看全文

- bla _KPC-2 -IS Kpn7 -IS Psy42 等携带 ESBL 和碳青霉烯酶基因 的具有水平转移潜力的序列，且相似的遗传环境已经在不同国家的医院源肠杆菌科细菌中广泛流行（图 3 ）。

本研究基于宏基因组技术揭示了斯里兰卡医院污水中 ESBL 和碳青霉烯酶基因的流行模式， Nanopore 长读长宏基因测序有效提升了对耐药基因及其水平、垂直传播机制的判别能力，提供了斯里兰卡污水中耐药基因传播规律的宝贵数据。此外，本研究也表明环境卫生设施建设对中低收入国家环境微生物风险控制具有重要意义， 多组学技术在基于污水的微生物风险监测方面具有应用潜力。

图 1 基于 Nanopore 宏基因组预测 ARG 宿主菌。标注 * 的为可能包含机会致病菌的细菌属，并进一步列举了这些属携带的 ARG 类型。

图 2 基于 Nanopore 宏基因组预测携带 ARG 的序列的可移动性，即质粒来源和染色体来源序列的比例。

图 3 ESBL 和碳青霉烯类耐药基因的遗传环境注释及其与 NCBI 数据库中相似序列的比较。

来源： 水质与微生物生态；中国科学院生态环境研究中心环境微生物技术研究组发布，作者：韩子铭，编辑：韩子铭，审核：张昱 。 投稿、合作 、转载、进群，请添加小编微信Environmentor2020！环境人Environmentor是环境领 域 最大的学术公号 ，拥有

请到「今天看啥」查看全文