正文
1878年成立参谋本部，陆军军令职能从陆军省划出，首任参谋总长山县有朋。参谋本部直属天皇，是统帅权独立于内阁的标志。海军于1889年设海军参谋部执掌军令职能，1893年改称海军军令部。1894年7月海军整合原有常备舰队与警备舰队，组建联合舰队担任大洋作战，以常备舰队司令兼任。对华备战期间日本最高当局首设大本营，开战后9月15日大本营从东京移驻广岛。日本陆海军外战组织框架从此延续至二战。
1876年《江华条约》后日本势力进入朝鲜，1884年为处理朝鲜甲申政变中、日发生冲突。1894年（明治27年）3月朝鲜东学道之乱，伊藤博文内阁（Ⅱ）邀约中国共同出兵。日本以第5师团步兵第9旅团为基干编成混成第9旅团先行入朝。中国派出叶志超、聂士成部在仁川以南牙山登陆，6月增派卫汝贵、马玉崑部驻平壤。中、日因处置朝鲜问题而起争端，7月25日中国运兵船从牙山返航在丰岛海域遭日本联合舰队第1游击队吉野、浪速、秋津洲号防护巡洋舰袭击。7月28日日军混成第9旅团长大岛义昌指挥所部进攻牙山，清军退守平壤，日本资料称此战为日本陆军首次与外军交战。8月1日中、日先后宣战。
参战日本陆军部队——
第1军，历任司令山县有朋、野津道贯，辖第3、5师团，7月始历经牙山、平壤、鸭绿江防线、凤凰城、岫岩、海城各战，1895年3月初攻占牛庄、营口、田庄台。
第2军，司令大山岩，辖第1、2、6师团，混成第12旅团，9月底渡鸭绿江后沿陆路横断辽东半岛，一部在庄河花园口登陆南下，10月9日占领金州，25日攻占旅顺。
大本营直辖第4师团担任辽东地区警备。
1895年1月日军大本营令第2军司令部指挥第2师团、第6师团步兵第11旅团攻打威海卫，1月20日先头部队第2师团步兵第16联队登陆荣成，2月3日占领威海，2月17日占领刘公岛。第2师团长佐久间左马太于4月5日任威海卫占领地总督。
日军大本营早有攻取直隶平原计划，1895年3月在旅顺设征清大总督府，参谋总长小松宫彰仁亲王兼任征清大总督，预定增调近卫师团和其他部队进攻京津。同时以陆军后备步兵第1联队组建台湾混成支队，3月23日登陆占领澎湖，准备夺取台湾。
未参战的近卫师团于《马关条约》签订后侵占台湾，本土还有新组建的临时第7师团。
1894年9月17日黄海海战日本海军部队序列——
联合舰队司令伊东祐亨；
联合舰队本队辖防护巡洋舰松岛（旗舰）、严岛、桥立、千代田，旧式舰扶桑、比叡；
第1游击队辖防护巡洋舰吉野（旗舰）、浪速、高千穗、秋津洲，炮舰赤城。
1894年12月日本海军组建旅顺口海军根据地队。
1895年3月30日李鸿章在日本达成停战协议（不包括台湾澎湖），4月17日签订《马关条约》。“三国干涉还辽”后，1895年10月中国交付辽东“补偿金”，日本于次年2月撤出辽东，第4师团回国，旅顺口海军根据地队撤销。
《马关条约》规定日军占领威海卫3年，赔款付清后交还。1895年11月底成立陆军威海卫占领军，首任司令第6师团步兵第11旅团长伊濑知好成，后由步兵第2、6旅团相继接防。1898年6月，威海卫占领军末任司令三好成行率部撤出回国。
三、八国联军侵华事件主力
1900年（明治33年）义和团事件期间，英、美、法、德、意、日、俄、奥匈八国首批432名海军及海军陆战队官兵6月1日从天津乘火车前往北京保卫使馆，其时日军爱宕号炮舰正在塘沽担任警备，舰上陆战队54人参加行动。
日本海军随后加派笠置号防护巡洋舰到大沽。6月10日八国再组织兵力2157人增援，日本陆战队320人由服部雄吉海军中佐率领参加。八国联军途中受中国军民阻击，6月17日发生大沽口炮台交战，服部雄吉重伤死亡。
八国继续增兵，日本在本土组建临时派遣队3300人于6月24日到达大沽，参谋本部第2部长兼西部都督部参谋长福岛安正少将任临时派遣队司令。福岛安正1883-1884年任驻华武官，是著名情报专家，能使用多种语言，随即成为八国联军司令部主要幕僚。
6月26日山县有朋内阁（Ⅱ）决定派第5师团步兵第11、42联队等部出征。7月14日八国联军占领天津，一个月后攻入北京，此时联军兵力有陆军49255人、海军4971人、舰船54艘，其中日本陆军20300人、海军540人、舰船18艘。
10月11日李鸿章自南方抵达北京主持和谈，各国缩减驻军，日本留置一个旅团兵力编成清国驻屯队，第5师团长山口素臣兼任司令。
日本海军常备（小）舰队司令出羽重远6月19日到达大沽指挥，先后投入装甲巡洋舰浅间号，防护巡洋舰笠置、秋津洲、高砂、千代田、松岛、千岁、浪速、吉野号，炮舰爱宕、鸟海号，驱逐舰阳炎号，通报舰龙田号。常备舰队司令东乡平八郎中将曾赴现场督察。
日本海军还在上海方面加强部署，8月上旬常备（小）舰队司令远藤喜太郎少将率防护巡洋舰严岛号，海防舰高雄号，炮舰赤城、摩耶号，铁甲舰扶桑号，水雷母舰丰桥号，通报舰宫古、八重山号巡弋海域，9月有海军陆战队450人上陆警戒。
义和团事件期间日本策划占领福建，防护巡洋舰和泉、高千穗号，炮舰筑紫号派驻厦门海域，8月23日陆军大臣致台湾总督“一旦有机会，需要立即占领厦门港”。8月24日和泉号防护巡洋舰陆战队借口一处教堂被焚登陆厦门，台湾总督派出一个旅团先头部队于28日航行至厦门海域，因英国施压日军后续行动取消。
