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15年前如果你不做mRNA表达谱你就out了，10年前如果你不做miRNA表达谱你就out了，5年前如果你不研究lncRNA表达谱你就out了，最近几年如果你没听说过circRNA你就落伍了。ceRNA又是何物，各种RNA的相互作用网络如何构建？
审时度势，与时俱进，本次培训将带你了解这些研究热点，这些非编码RNA如何产生，如何行使生物学功能，如何相互作用构成生物网络，我们将为你一一道来。
他山之石可以攻玉
同行是如何研究这些热点的，哪些方法可以为我所用。我们将和你分享一些成功案例，梳理研(fa)究(wen)思(tao)路(lu)。
纸上得来终觉浅，绝知此事要躬行
看着人家发文章似乎很容易，自己做起来却无从下手。本次培训将手把手教你如何从RNAseq数据（mRNA, lncRNA, miRNA）得到差异表达基因，基因功能富集，生存分析，ceRNA网络构建。教你画出火山图，柱状图，聚类图，热图，气泡图，KM生存曲线，ceRNA网络图。
学员评价
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课程亮点
1、展示高质量paper，阐述非编码RNA发文套路；
2、讲解从mRNA, lncRNA, miRNA数据筛选差异表达基因的方法，直通关键分子；
3、传授非编码RNA靶点的预测方法，构建网络机制；
4、介绍miRNA，circRNA，lncRNA各种数据库、实用工具及其使用方法，充实科研武器库；
5、系统性重复非编码RNA文章中的常见图，用模块化代码绘制一整套分析图，自己修改少量参数便可直接上手，比如这个：
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还有这个，
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统统都给你！
会议信息
时间：2019年6月1-2日（周六、周日）
地点：上海书香世家酒店（上海市闵行区吴中路1389号）
主讲人
李老师，生物信息学博士，有八年的测序数据分析经验。博士期间参与多个课题项目，涉及机器学习，芯片数据分析，核酸及蛋白序列分析，全基因组甲基化测序数据分析，全转录组测序数据分析，miRNA及靶基因分析，癌症相关基因预测及预后分析等，发表SCI论文32篇，其中一作及并列一作15篇。
工作期间积累了丰富的DNA，甲基化，RNA捕获测序，Amplicon捕获测序实验流程和数据分析经验。具有ctDNA数据分析经验，对变异数据进行注释, 指导临床用药。自行搭建Linux集群，开发测序数据全自动分析平台。
适合人群
广大临床/科研工作者，研究生，有无生信基础均可参加，有R语言基础者更佳。
课程表
Day1 |
8:00-9:00 | 报道，领取资料 |
9:00-12:00 | 背景知识介绍 |
miRNA，circRNA，lncRNA的产生，作用机制，功能 |
miRNA，circRNA，lncRNA相关数据库及工具介绍，使用及数据下载 |
ceRNA案例分享 （包括mRNA-miRNA-lncRNA网络和mRNA-miRNA-circRNA网络） |
12:00-13:00 | 午休 |
13:00-17:00 | 差异表达分析（实操，无需编程） |
TCGA介绍及数据下载 |
TCGA数据合并及标准化 |
鉴定差异表达mRNA，lncRNA，miRNA（基于limma,edgeR,DESeq2三种方法），三种方法比较，韦恩图 |
箱式图, 主成分分析, 火山图 |
根据不同pvalue，fold change筛选差异表达基因 |
ID转换 |
GO，KEGG富集分析（DAVID） |
17:00-17：30 | 学员提问及讨论 |
Day2
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9:00-12:00 | ceRNA网络构建流程介绍及数据准备 |
R安装，相关包安装，简单介绍 |
ceRNA网络构建流程讲解 |
相关数据下载，准备 |
12:00-13:00 | 午休 |
13:00-17:00 | ceRNA网络构建（实操，基于R） |
差异表达mRNA，lncRNA，miRNA鉴定 |
火山图，热图，聚类图，柱状图 |
差异表达基因GO,KEGG富集分析，气泡图，柱状图，KEGG通路图展示 |
mRNA，lncRNA表达相关性分析，点状图 |
mRNA, lncRNA, miRNA网络构建，cytoscape展示，hub基因筛选 |
17:00-17:30 | 学员提问及讨论 |
注：
1、实际授课过程中，老师可能根据学员学习速度对课程进行微调。
2、请学员自带电脑，请使用windows系统（请勿使用XP系统，推荐win10），老师用win10系统进行讲解；电脑配置推荐8G及以上内存，否则部分软件运行可能会卡；想做个生信小能手，8G内存是标配！
3、为了提高学习效率，本次课程会提前发给学员从数据库中下载数据的视频教程，同时也会提供下载好的数据以及相关代码，方便学员提前进行预习。
报名费：
5月26日前 | 5月27日至31日 | 现场报名缴费 |
3000 | 3200 | 3500 |
两人组团报名，每人可优惠100元
三人组团报名，每人可优惠200元
四人及以上组团报名，每人可优惠300元
注：本次学习班提供两天的午餐，其余食宿费用自理，本次培训班按报名顺序排座位号，建议尽早报名。
特别说明：
之前参加过依凡老师“实用数据挖掘及案例实操班”线下数据挖掘培训课程的学员参加本次培训效果可能更佳，为了鼓励以往学员在之前的基础上更进一步，之前参加过“实用数据挖掘及案例实操班”的学员，报名本次培训班立减200元。
反之，参加本次培训班的学员报名“实用数据挖掘及案例实操班”，也可优惠200元。
报名请联系特雷西（微信号：xzlky2015-training），加微信时请注明“姓名+报名咨询”
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