专栏名称: 上海交大巴黎高科评论
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合成生物学:产业前景如何?

上海交大巴黎高科评论  · 公众号  ·  · 2016-09-19 16:39

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然而,直到二十世纪50年代和60年代,合成生物学开始被从技术的角度来考虑,电子显微镜等工具的发展,使得在分子水平上对生物学进行理解取得重大进步:其中之一是DNA在1953年的发现。

同时,越来越明显的是,即使进化是随机的,数学原理却仍然主宰着生物网络。之后,在20世纪90年代末,系统生物学的兴起提供了肥沃的土壤,一些工程师开始把注意力集中在此。他们的座右铭:不能被创造的东西,就是我不了解的,这句来自物理学家理查德·费曼的名言,是他在加州理工学院期间的一次演讲中提出的。

我们知道,在世纪之交,德鲁·恩迪(Drew Endy)和汤姆·奈特(Tom Knight)奠定了合成生物学的基础。他们在2004年发起的iGEM学生竞赛,对合成生物学的发展至关重要,导致后者在2007年在法国巴黎的跨学科研究中心被介绍。正是通过参与这一竞争,许多研究人员被吸引到这一新兴领域。

合成生物学的支持者在分子生物学中引入了一些原理,直接灵感来自于工程学:模块化、标准化和抽象化。“生物积木”的概念,就是指一段标准化、可重复使用、呈现出某种特定行为特征的DNA序列。

生命小工厂

合成生物学既是笛卡尔主义又是还原论。但是对生物学过度简化,可能会导致忽略活生物体在几十万年的演化中发现的某些“机巧”,这些“机巧”能教给我们很多有趣的知识。

活生物体是非常有效的。例如,细胞成分在空间中的组织严密,存在各种被称为“细胞器”的隔间。许多细菌专门在这些微室进行某些代谢反应,从而提高了相关酶的效率。很容易地理解,人为地控制这些代谢通道的空间组织将会多么有趣。

这是DNA纳米技术的来源。该区域使用DNA碱基互补在一个纳米级尺度内设计基因片段,按照某种预定模式:在二维或三维空间内构造的纳米线(nanowires)。是否可以利用这门科学来构建人工“细胞器”来隔离某种代谢途径,从而提高其精度和性能?

在纳米技术和合成生物学之间建立一座桥梁不是一件容易的事。首先,DNA纳米技术以前只是试管科学。如何通过20年的体外实验,同时管理该领域所要求的所有排列原则,使其在体内正常工作?还有,如何用RNA代替DNA?RNA可以在细菌细胞中大量生产,但需要解决稳定性的问题。最后,如何在体内表征这些结构?在科学的崎岖道路上冒险,往往需要开发新的探索技术。

在这么多领域之间的前沿工作需要开发新的实验方法和思维科学,但也带来了一些监管问题,这些问题对道德发生影响——虽然我们现在不会讨论——必须进行辩论。






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