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昆士兰大学郭建华团队Nat. Microbiol.综述及Nat. Commun.等研究成果:短链气态...

环境人Environmentor  · 公众号  ·  · 2025-04-25 12:42

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1. 短链气态烷烃的源与汇


好氧短链气态烷烃氧化微生物及代谢通路

Actinobacteria 门的革兰氏阳性菌 “CMNR ” ( Corynebacterium , Mycobacterium , Nocardia , Rhodococcus ) 包含了大多数的好氧 SCGAs 氧化菌群。其他革兰氏阳性细菌(如 Arthrobacter )和少数革兰氏阴性细菌(如 Acinetobacter , Burkholderia , Pseudomonas )也已被证明能够在好氧条件下利用短链气体烷烃。同时,一些好氧甲烷氧化菌也被报道具有兼性代谢 SCGAs 的多样性。

类似于好氧甲烷氧化,好氧 SCGAs 氧化首先通过烷烃单加氧酶催化 C-H 键的裂解并引入分子氧来激活烷烃。例如,乙烷通过单加氧酶被氧化为乙醇,再通过醇脱氢酶和醛脱氢酶转化为乙醛和乙酸。丙烷氧化则可在末端和亚末端碳原子处发生,导致不同的氧化产物。除了使用氧气作为电子受体外,好氧 SCGAs 氧化微生物在氧气限制条件下也可能利用硝酸盐等替代电子受体,这为 SCGAs 降解微生物提供了在不同氧梯度下存活的代谢灵活性。


2. 甲烷及短链气态烷烃的好氧和厌氧代谢途径


3. 甲烷及短链气态烷烃单加氧酶系统发育树


厌氧短链气态烷烃氧化微生物及代谢通路

厌氧短链气态烷烃氧化微生物可被分为细菌与古菌

细菌: 目前已知的大多数厌氧 SCGAs 降解细菌属于广泛分布的海洋硫酸盐还原菌 (SRB) 群体,这些细菌隶属于 Deltaproteobacteria 中的 Desulfosarcina/Desulfococcus (DSS) 簇。此外, Bacillota 门的细菌也被发现能进行厌氧 SCGAs 降解,例如,课题组首次富集的 Candidatus Alkanivorans nitratireducens” 是目前已知唯一能使用硝酸盐驱动的厌氧乙烷、丙烷和丁烷氧化菌。这表明,厌氧 SCGAs 降解菌可能具备比预期更广泛的代谢潜力。细菌主要通过 C-H 键的裂解激活其底物,并将生成的烷基自由基加到富马酸上,生成烷基琥珀酸,第一步由关键基因烷基琥珀酸合成酶 (ASS) 调控。

古菌: 最近研究表明,某些古菌与硫酸盐还原菌共生,能够利用类似厌氧甲烷氧化的代谢机制进行硫酸盐介导的厌氧 SCGAs 氧化。比如, Ca . Syntrophoarchaeum’ 能通过类似甲基辅酶 M 还原酶 (MCR) 的烷基辅酶 M 还原酶 (ACR) ,将丁烷氧化为其代谢产物。其他古菌,如 Ca . Argoarchaeum’ Ca . Ethanoperedens’ ,也在与 SRB 的共生关系中,通过乙基辅酶 M 还原酶 (ECR) 氧化乙烷。

此外,厌氧 SCGAs 氧化古菌多样性可能远超预期。除了已知的微生物类群外,目前,所有已确认的厌氧 SCGAs 氧化古菌均属于 Halobacteriota 门中的 Methanomicrobia 纲。然而, Halobacteriota 的其他类群,如 Archaeoglobi Hadesarchaea Methanoliparia ,所含的酶与典型的 MCR 不同,但在系统发育上与厌氧 SCGAs 氧化菌的 ACR 相关。这表明,这些古菌可能具备氧化 SCGAs 的能力。此外,厌氧 SCGAs 降解可能不仅限于 Halobacteriota 门。属于其他古菌门如 Bathyarchaeota TACK 超门)、 Heimdallarchaeota Asgard 超门)和 Helarchaeota Asgard 超门)的基因组也存在 ACR 而被预测为潜在的 SCGAs 降解菌。古菌 SCGAs 降解菌都是通过形成烷基辅酶 M 衍生物来激活烷烃的,关键酶为 ACR



4. 厌氧短链气态烷烃氧化细菌和古菌的系统发育树及代谢能力 / 潜能

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展望

微生物 SCGA 氧化不仅能减少 SCGA 排放,还为污染物生物修复和增值产品生成提供了可能。 SCGA 可作为电子供体用于地下水污染物的去除,与传统的有机电子供体技术相比,具有更低的成本和更少的二次污染。此外, SCGA 还可转化为单细胞蛋白、生物塑料等增值产品,提供了环保和经济的解决方案。

目前难以确定微生物 SCGA 消耗能在多大程度上缓解全球 SCGA 排放,因为缺乏对 SCGA 热点地区原位微生物 SCGA 氧化活动的研究。此外,缺乏定量数据来明确描述好氧和厌氧氧化 SCGA 对全球 SCGA 循环的贡献,阻碍了其对全球碳预算和气候影响的准确评估。未来的研究应集中在原位 SCGA 氧化活动的调查、氧化速率的量化以及不同微生物群体在 SCGA 循环中的角色。通过多组学技术和实验室富集培养的结合,揭示更多厌氧 SCGA 氧化微生物的多样性和代谢潜力,为气候变化应对和环境修复提供新的生物技术。


5. 微生物短链气态烷烃氧化对缓解其对气候负面影响的意义

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