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Nature Methods | 无标记代谢成像的未来:URV-SRS技术的深远影响

生物探索  · 公众号  · 生物  · 2025-01-19 15:30

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传统的SRS技术虽然能够无标记地成像代谢物,但其面临着灵敏度不足和空间分辨率有限的挑战。具体来说,传统SRS由于受到激光光源功率限制,难以在细胞和亚细胞级别实现高灵敏度的代谢成像。为了解决这一问题,URV-SRS通过对激光脉冲的延时调制(chirping)技术,显著增强了信号的探测能力。这种技术通过扩展脉冲的持续时间,从而降低峰值功率,减少了光子损伤的风险,并使得成像在更低的功率条件下依然能获得高质量的信号。这一创新不仅提高了成像的安全性,也扩展了其在生物样本中的应用范围。
除了脉冲调制技术外,URV-SRS还结合了去噪算法,进一步提升了成像的质量。在URV-SRS中,研究人员引入了自监督学习的去噪算法——NACE(Noisy-As-Clean with consensus equilibrium)。该算法通过生成多个带有噪声的图像对,并在不同的信噪比条件下训练去噪网络,有效去除了由于样本噪声带来的影响,使得信号更加清晰。这一算法的引入,大大提升了图像的信噪比,降低了背景噪声,从而使得细胞内低浓度代谢物的探测变得更加精准。

基于URV-SRS的无标记代谢成像原理 (Credit: Nature Methods

光学设置(a): 图a描述了URV-SRS的光学系统配置,包括了各个关键组件的功能,如分光镜(DM)、光学调制器(OM)、扫描单元(SU)、扫描镜头(SL)等。该设置支持激光源的调节和高效的信号收集,使得代谢成像能够在纳米尺度上进行。
细胞光损伤阈值(b): 图b展示了不同脉冲持续时间下,细胞光损伤的阈值功率。通过对多种细胞类型的生物学重复实验(n=3)进行分析,图中的误差条反映了光损伤的功率范围,提供了URV-SRS成像在不引起细胞损伤的条件下所能使用的功率上限。
检测限(c): 图c通过对DMSO分子的检测,展示了可见光和近红外(NIR)SRS的检测限。图中斜线表示SRS峰值强度与分子数量之间的线性关系,垂直虚线表示基线强度加上3倍标准差(σ)的分子数,进一步验证了URV-SRS在检测低浓度代谢物时的高灵敏度。
NACE去噪工作流(d): 图d展示了自监督去噪算法NACE的工作流程。该流程通过生成多个噪声对(zk - y),并在不同信噪比(SNR)条件下训练U-Net去噪网络,最终通过共识平衡(Consensus Equilibrium)整合网络,进行匹配信噪比的去噪,从而提高成像信号的质量。
光学传递函数(e): 图e展示了泵浦光、SRS和傅里叶重标定(FUR)SRS的光学传递函数(OTF)。图中标出了泵浦光、斯托克斯光和SRS的空间频率截止值,进一步证明了FUR技术在提高分辨率方面的优势。
SKOV3卵巢癌细胞成像(f): 图f展示了使用FUR技术和NACE去噪后,对SKOV3卵巢癌细胞在2,930 cm⁻¹的可见SRS成像结果。通过实验验证,FUR和NACE的结合显著提升了图像的分辨率和清晰度。
图像区域放大(g): 图g展示了图像放大的效果,包括原始图像、NACE去噪后的图像和FURNACE(NACE + FUR)增强分辨率后的图像,显示了FURNACE技术如何提升图像的清晰度。
直接应用FUR(h): 图h展示了直接对原始图像(y)应用FUR处理后的效果,验证了FUR在提升分辨率方面的实际效果。
线剖面分析(i): 图i展示了对图1g中两条箭头之间的线剖面进行的分析,帮助定量评估FURNACE处理后图像分辨率的提升。
FRC分析(j): 图j展示了对原始图像、NACE去噪图像和FURNACE增强图像的单幅图像FRC(傅里叶环相关)分析结果。FRC分析定量测量了每个图像的空间分辨率,验证了FURNACE的效果,显示FURNACE提升了分辨率,并满足1/7分辨率标准。

细胞代谢成像的全新视野






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