肿瘤免疫细胞浸润分析服务

肿瘤免疫细胞浸润是近年来的一个热点，无论是基础研究还是数据挖掘都是比较热的，这里我们主要讲一下数据挖掘，因为这个成本比较低，而基础研究成本高，不是人人都能做的。

GEO数据和TCGA数据可以做，自己的测序数据也可以做，得到数据后，我们就可以将其转化成22种免疫细胞所占百分比的矩阵（CIBEＲSOＲT 软件转换），后面的分析跟其分析也是差不多的，画几张图，搞个模型，做一个生存分析。这里我们主要讲解一下TCGA数据，主要是因为TCGA里面有临床数据，下面我们来看看具体的操作：

1、下载TCGA mRNA FPKM格式的数据，转化整成具有gene symbol的矩阵，同时下载临床数据

2、使用limma包矫正一下数据，然后是用CIBEＲSOＲT 软件转换成22种免疫细胞的矩阵（网站或者代码都额可以实现）

3、这里主要是画一些图看看，这些图可有可无

4、也可以做一下免疫细胞之间的相关性，正常样本与癌症样本的差异分析

5、可以搞个模型

6、同时还可以做搞一下免疫细胞与临床特征的相关性

按照这个思路发篇SCI应该没有什么问题，上面的分析都可以找我们做，SCI狂人团队会员可以免费帮做一次这样的分析，有需要的同学可以加微信：scikuangren

注意事项：我们这里的分析是纯粹的分析，结果是怎么样的由数据决定，分析中有很大可能有些图是做不出来或者做出来的图很丑，结果中p>0.05这些可能都是存在的，我们这里的分析就是纯粹的分析，什么都不包，结果是怎么就是怎么样，与我们无关。

可能很多人将我们的数据分析服务理解成了其他公号的生信课题定制性分析服务，人家的是全包的（漂亮的图一定可以出来，结果全是阳性，总之就是包文章被接收），价格是我们的10倍以上，听说一些学员说价格在3万~15万之间。