上海市肺科医院周彩存教授团队蒋涛博士2项研究入选2018ESMO壁报讨论

背景：本研究旨在全面描绘中国肺鳞癌人群基因组突变特征及其与TMB、CD8+ TIL和PD-L1表达的关系

方法：189例中国肺鳞癌样本进行全外显子组测序，高TMB定义为大于总体的75%分位数，CD8+ TIL 和PD-L1的表达通过IHC检测，阳性cut-off值均定义为>5%。PD-L1的表达使用两种型号的抗体（SP142和E1L3N）进行检测。

结果：共有8个高频突变基因和6个基因拷贝数变异被发现，包括TP53、KMT2C, NFE2L2、KEAP1、CDKN2A、PTEN、FBXW7 和 PIK3CA等。其中FGFR1和PIK3CA的扩增比率分别为19%和11%。除吸烟史外，基线特征资料与TMB表达无关。PD-L1和CD8+ TIL阳性率分别为24.3%和78.8%。值得注意的是，TMB表达与PD-L1或CD8+ TIL阳性率均无相关性。TMB、CD8+ TIL和PD-L1表达单一指标均不能预测预后，但是TMB联合PD-L1或CD8+ TIL可以很好地预测预后。进一步根据PD-L1和CD8+ TIL表达情况将肿瘤微环境分成4种类型，4种类型的TMB水平并没有显著差异，预后存在一定得差异。

结论：这是迄今为止样本量最大的关于中国肺鳞癌人群基因组突变特征及其与TMB、CD8+ TIL和PD-L1表达关联分析研究。

背景：以新抗原为基础的肿瘤个体化疫苗治疗显示了非常强大的抗肿瘤效果。但是，我们目前还没有数据证实从原发灶获取的新抗原信息是否和远处转移灶存在异质性。

方法：14例患者的原发灶和匹配的远处转移灶及其外周血细胞在患者接受任何治疗以前搜集贮存。所有样本进行深度全外显子测序，新抗原定义为肿瘤特异性突变，倍数变化>10，具有MHC高亲和力（IC50 < 500 nM），预测肽段长度在9-11个氨基酸。

结果：新抗原突变数目在原发灶和转移灶都有着非常广泛的分布。两者新抗原数目存在明显相关性。对新抗原分布进行标准化后发现，20%的新抗原同时存在于原发灶和转移灶（克隆性新抗原），进一步研究发现此类新抗原主要来源于SNV和Indel。与原发灶相比，转移灶拥有更大比例的亚克隆性新抗原。亚克隆性新抗原的比例受到吸烟史、原发灶组织学类型和转移器官部位的影响。新抗原图谱分析发现，不存在同一新抗原同时表达于所有样本中。此外，克隆性新抗原所对应的HLA类型也存在较大异质性。新抗原的数量、质量和对应的HLA类型的异质性在孤立性脑转移多点取样样本中也被观察到。

结论：新抗原在原发灶和转移灶的分布均存在明显的异质性，这种异质性对后续肿瘤个体化疫苗治疗的影响需要进一步研究。