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Science | 免疫系统的“记忆库”被打开?机器学习诊断准确率逼近99%

生物探索  · 公众号  · 生物  · 2025-02-25 16:35

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单次全身PET-CT检查辐射量相当于200次X光胸片
研究数据显示,传统检测对狼疮的诊断灵敏度仅85%,特异性不足70%。而Mal-ID模型在区分狼疮患者时,达到 93%灵敏度和90%特异性 ,相当于在100名真实患者中正确识别93例,同时将健康人误判为患者的概率控制在10%以内。

Mal-ID:当机器学习遇见免疫组学
这项革命性技术融合三大创新:
蛋白质语言模型: 将受体序列转化为650维数学向量,捕捉肉眼难辨的分子特征
深度聚类算法: 识别跨个体的"公共克隆"(Public Clones),发现新冠患者共有的IGHV1-24受体家族
多模态集成学习: 整合BCR/TCR双通道数据,诊断准确率比单一指标提升12%
研究团队对593人的1600万条BCR和2300万条TCR序列进行深度学习。结果显示,联合使用B/T细胞数据时,模型在区分6种免疫状态时表现出最优性能。特别是在新冠检测中,模型优先识别IgG型抗体——这与已知的血清转化规律完美吻合。

数据的力量:从分子特征到疾病指纹
研究揭示关键发现:
特异性序列标记: 新冠康复者血液中,IGHV2-70基因的使用频率是健康人的3.2倍
动态演化规律: 流感疫苗接种7天后,特定IgG克隆扩增幅度达接种前的40倍
治疗反应监测: 接受治疗的狼疮患者,其异常TCR信号强度与SLEDAI疾病活动指数呈正相关
通过"模型可解释性"技术,研究人员发现Mal-ID的决策依据与已知免疫学知识高度一致。例如,在识别新冠患者时,模型赋予SARS-CoV-2刺突蛋白结合抗体的权重是随机抗体的6.9倍。

多病联检:从单线作战到全景扫描
传统检测如同"单孔望远镜",每次只能观察特定指标。Mal-ID却像"广角镜",一次血液检测即可评估: 病毒感染(新冠、HIV)、 自身免疫病(狼疮、糖尿病)、 疫苗应答和 健康基线状态。
在扩展验证中,模型对51名仅含BCR数据的患者仍保持95.9%的准确率。这意味着未来可能通过常规血检实现疾病早期筛查, 特别是对于症状重叠的疑难病例

狼疮诊断的破局时刻
系统性红斑狼疮的诊断历来是医学难题。研究显示:
模型识别出IGHV4-34基因的异常激活,该基因编码的抗体易攻击DNA






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