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dPCR 标准化之路的机遇与挑战

生物制品圈  · 公众号  · 生物  · 2025-06-03 14:48

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参考物质是具有足够均匀性和稳定性的材料,用于校准测量系统和质控。其中, certified reference material(CRM)需通过计量学 valid 程序认证,附带不确定度和溯源性声明。例如,NIST 开发的 SRM 2373 和 RM 8366 通过 dPCR 定值,用于癌症基因拷贝数检测的校准。

2.2 dPCR 对传统方法的革新

在 dPCR 普及前,紫外光谱法、核酸结合染料等间接方法常用于核酸定量,但这些方法无法区分目标序列与杂质,且易受样本基质影响。dPCR 则通过 特异性扩增 直接测量目标序列,尤其适用于复杂基质中低丰度核酸的表征,如血浆游离 DNA 或病毒 RNA。

三、dPCR 测量准确性的影响因素

3.1 实验设计的关键要素

  • 引物与探针优化 :需验证退火温度、浓度及多通道检测时的光谱干扰,避免 “通道串扰”。

  • 分区体积校准 :仪器标称体积可能存在偏差,计量机构需通过实验测量实际体积,以降低浓度计算误差。

  • 参考基因选择 :在比值测量(如癌症基因拷贝数)中,需确保参考基因拷贝数稳定,避免因基因组变异导致结果偏移。

3.2 样本前处理的技术要点

  • 核酸完整性 :环状质粒需线性化以提高扩增效率,基因组 DNA 可通过酶消化或超声破碎减少二级结构影响。

  • 抑制物控制







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