正文
TEV蛋白酶(TEV protease)
的“精准钥匙”才会发挥作用。
具体来说,研究团队利用了MS2噬菌体衣壳蛋白(MS2 coat protein,MCP)与MS2 RNA发夹结构(MS2 RNA aptamer)的特异性结合,以及BoxB RNA发夹结构(BoxB RNA aptamer)与λ噬菌体N蛋白(λN peptide)的相互作用。他们将MCP融合到ADAR2DD-ADI复合物上,并设计了一段包含MS2和BoxB RNA发夹结构的引导RNA(engineered agRNA,eagRNA)。同时,他们还引入了TEV蛋白酶的N端片段(TEVn)和C端片段(TEVc),其中TEVc与λN肽融合。
当eagRNA与目标RNA结合后,MCP-ADAR2DD-ADI复合物会被招募到目标位点。与此同时,游离的TEVn也会扩散到目标位点,并与TEVc结合,形成完整的、具有活性的TEV蛋白酶(TEVp)。TEVp能够特异性地识别并切割ADI,解除ADI对ADAR2DD的抑制。一旦“分子锁”被打开,ADAR2DD就会被激活,开始高效地对目标RNA上的腺嘌呤进行编辑,将其转化为肌苷。
这种“先抑制后激活”的策略,就好比一把只有在特定条件下才能解锁的工具,确保了RtABE只在目标RNA位点进行编辑,从而实现了极高的编辑特异性,有效避免了“脱靶”效应的发生。
示意图
(Credit:
Nature Biotechnology
)
小鼠模型显神威:RtABE成功治疗罕见病带来新希望
为了验证RtABE技术的有效性和安全性,研究团队选择了一种名为黏多糖贮积症I型(Hurler syndrome)的罕见遗传病小鼠模型进行实验。这种疾病是由于编码α-L-艾杜糖醛酸酶(α-L-iduronidase,IDUA)的基因发生突变,导致患者体内无法正常分解特定的糖类物质,进而引发一系列严重的健康问题,包括骨骼畸形、智力障碍和器官功能衰竭。
研究人员通过腺相关病毒(adeno-associated virus,AAV)将编码RtABE的遗传物质递送到患病小鼠的肝脏细胞中。肝脏是合成和分泌α-L-艾杜糖醛酸酶的主要器官。实验结果令人惊喜!研究发现,经过RtABE治疗后,小鼠肝脏细胞中α-L-艾杜糖醛酸酶的活性得到了显著恢复。这表明RtABE成功地对突变的RNA进行了编辑,产生了功能正常的酶。
更重要的是,研究团队对接受RtABE治疗的小鼠的多个组织(包括肝脏、脾脏、肾脏、心脏和大脑)进行了全面的脱靶编辑分析。他们利用高通量测序技术,检测了这些组织中是否存在非目标RNA的编辑事件。结果显示,与传统的RNA编辑方法相比,RtABE的脱靶编辑水平非常低,几乎可以忽略不计。这充分证明了RtABE具有出色的靶向性和安全性,为将其应用于临床治疗罕见病奠定了坚实的基础。
此外,研究人员还检测了接受RtABE治疗的小鼠的疾病相关指标。他们发现,经过治疗后,小鼠体内与黏多糖贮积相关的代谢产物水平显著降低,疾病症状得到了明显的改善。这些结果进一步证实了RtABE在治疗黏多糖贮积症I型方面的巨大潜力。
多重实验验证:RtABE展现高效性和广谱性
除了在黏多糖贮积症I型小鼠模型中的成功应用,研究团队还进行了多项额外的实验,以更全面地评估RtABE技术的性能。
他们设计了不同的引导RNA(eagRNA),靶向不同的RNA序列,发现在多种不同的序列背景下(包括UAN、AAN、CAN和GAN等),RtABE都能够高效地进行A-to-I的编辑。这表明RtABE具有广泛的适用性,可以用于编辑各种不同的RNA靶点。
为了进一步验证RtABE的特异性,研究人员还进行了敲低实验(knockdown experiment)。他们利用小干扰RNA(small interfering RNA,siRNA)敲低了目标RNA的表达,结果发现RtABE的编辑活性也随之显著降低。这表明RtABE的编辑是高度依赖于目标RNA的存在的,进一步证实了其靶向性。研究人员还通过蛋白质印迹法(Western blot)分析了在目标转录本被敲低时A3DADI的切割情况,结果与RT-qPCR数据一致,进一步支持了RtABE的作用机制。
此外,研究团队还对RtABE的组成部分进行了优化,例如对ADAR2DD进行了突变改造(E488Q),以进一步提高其编辑效率和特异性。他们还探索了不同的递送方式,例如利用腺相关病毒(AAV)进行体内递送,为未来的临床应用提供了更多的选择。