专栏名称: 弗雷赛斯
Freescience由浙江大学医学院几个硕博士发起创建,旨在最广泛分享有价值的科研技能和知识;FreeScience的宗旨:“科学自由分享、人人平等,共求真理”。
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生信学习革命| 火山图绘制工具

弗雷赛斯  · 公众号  · 科研  · 2017-10-07 11:09

正文

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软件界面如下:

导出PDF结果如下:

火山图绘制工具下载链接:http://gap.shengxin.ren/tool/5/(点击阅读原文前往下载)

1、首先我们选择一套GEO数据集GSEXXXX,然后使用GEO2R的在线工具(或者使用生信人的差异分析小工具*看这里: 如何极其简单的使用GEO数据来做差异分析 )筛选差异表达基因,我们将得到所有基因的差异表达情况,比如GEO2R输出的GEO2R processing request....txt文件。

文件格式:

2、打开火山图绘制工具软件

3、导入数据点击绘制

4、改改颜色,改改CutFC或者CutPvalue,还有X,Y轴的最大最小值,反正都可以试一下







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