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Nature Biotechnology | 基因快递车再升级:研究人员破解精准投递超大包裹的秘密

生物探索  · 公众号  · 生物  · 2025-03-21 16:35

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增强子和启动子在不同的AAV基因组中存在广泛的转录串扰 (Credit: Nature Biotechnology

破解"病毒拼图"的分子密码
要解开转录串扰之谜,传统检测手段力有不逮。研究团队创新开发了两种空间基因组学技术: AAV-Zombie 能像"病毒CT"般在完整组织中定位单个AAV基因组; SpECTr技术 则专门捕捉病毒基因的串联体(Concatemer)。
在神经元培养实验中,SpECTr首次动态展示了病毒基因组在细胞内的命运:注射后24小时内,超过60%的病毒DNA在细胞核内形成多聚体。这些串联体就像分子"拼图",将不同病毒上的增强子和启动子物理连接,重现了天然染色体上"增强子-启动子"互作的空间构象。当使用DNA修复缺陷的SCID小鼠(Prkdcscid/scid)时,串联体形成减少78%,转录串扰效率随之暴跌,直接验证了分子拼图假说。

改写基因的"细胞狙击枪"
利用这种天然机制,研究人员设计了分体式基因编辑系统:一个病毒携带Cas9核酸酶(3.2kb),另一个装载Ple155增强子。在小鼠实验中,这种"分体快递"成功实现了浦肯野细胞的精准编辑。相比传统方法,靶向细胞编辑效率提升177倍,而非目标组织(如肝脏)的脱靶效应降低97%。
更令人振奋的是,这种策略无需转基因动物配合。在野生型小鼠中,仅通过系统性注射(Systemic administration)就重现了Cacna1a基因敲除的经典表型:接受编辑的小鼠出现运动失调(Ataxia),在狭窄横梁测试中失误率增加3倍,步态分析显示四肢协调性下降62%。而通过EEG监测发现,传统全身编辑会引发癫痫样放电,但分体式系统将异常放电控制在基线水平,展现出卓越的安全性。

从实验室到临床的"破壁"意义
这项发现正在改写基因治疗的规则手册:
超大基因装载: 将CRISPR激活系统(CRISPRa)、碱基编辑(Base editing)等"大块头"工具送入特定细胞
精准调控: 通过组合不同增强子,实现器官-细胞层级的精细调控
非人灵长类突破: 已有实验室用工程化AAV(AAV.CAP-B10)在猕猴脑内实现跨脑区编辑
临床转化捷径: 避免繁琐的转基因动物制备,直接使用普通实验动物
更令人期待的是,配合新开发的BBB穿透型AAV(如PHP.eB),未来或可实现单次注射治疗多脑区疾病。

改写生命密码的"安全锁"






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