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二区5.7毕业神刊:单细胞测序分析中性粒细胞异质性亚群及胶质瘤预后模型

小张聊科研  · 公众号  · 科研  · 2025-06-04 19:13

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胶质母细胞瘤( GBM )是中枢神经系统中最常见且最具侵袭性的恶性肿瘤。尽管近年来在肿瘤治疗领域取得了诸多进展,但 GBM 患者的预后仍然不容乐观。在临床实践中,作者发现 GBM 的肿瘤微环境( TME )中存在大量免疫细胞,尤其是中性粒细胞 。然而,目前对于 GBM 相关中性粒细胞( GBMAN 的功能和异质性研究仍然不足。因此,作者决定从单细胞水平上深入研究 GBMAN 的亚群特征及其在肿瘤微环境中的作用。

第一步:大规模单细胞 RNA 测序揭示 GBMAN 亚群

为了全面了解 GBMAN 的异质性,作者收集了来自 127 IDH 野生型 GBM 样本的单细胞 RNA 测序( scRNA-seq )数据,涵盖了 498,747 个细胞。 通过严格的质量控制和批次效应校正,作者成功整合了这些数据,并利用 UMAP 算法进行降维聚类分析。最终,作者鉴定出 15 种不同的细胞类型,其中 包括肿瘤相关中性粒细胞( TAN )。 进一步对 TAN 进行亚群分析, 作者发现了四个不同的 GBMAN 亚群: MNDA+GBMAN







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