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测序周报 · 科研篇:Nature颠覆性研究揭示胎儿特殊免疫系统

测序中国  · 公众号  ·  · 2017-06-18 17:17

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1. 在6月15日发表在 Cell 杂志 的一篇文章中,斯坦福大学Pritchard教授和另外两名遗传学家提出, 许多GWAS研究的结果与疾病没有特定的生物相关性,更不能成为良好的药物靶点。相反,这些“周边”变异可能通过复杂的生物化学调节网络,进而影响与疾病直接相关的几个“核心”基因的活性。

2. 2017年6月15日,北京大学生命科学学院BIOPIC中心、北京未来基因诊断高精尖创新中心、北大-清华生命科学联合中心张泽民研究组,首都医科大学附属北京世纪坛医院暨北京大学第九临床医学院肝胆胰外科彭吉润研究组,及美国AMGEN公司的欧阳文军研究组在 Cell 杂志 发表了最新研究论文 首次在单细胞水平上描绘了肝癌微环境中的免疫图谱。

3. 6月15日,来自于美国贝勒医学院王萌教授团队在 Cell 期刊发表了一篇题为“Microbial Genetic Composition Tunes Host Longevity”的文章,首次系统研究了共生细菌与宿主衰老的关系。他们惊喜发现:细菌中有多达数十个基因,在被删除后,能够显著延长宿主线虫的寿命!

4. 日前,一个致力于开发生物工程人类肝脏组织的国际研究小组表示,已发现了以前未知的遗传-分子串扰网络,控制器官的发育过程。研究人员表示,这项研究将大大推进了人类多能干细胞的发展,对创造出健康可用的人类肝组织具有重大意义。 相关研究在6月14日在线发表于 Nature 杂志。

5. 近日,一项刊登在国际杂志 Nature Genetics 上的研究报告中,来自多伦多大学等机构的研究人员进行了一项大型的全基因组关联性研究,他们利用多个癌症研究机构所开发的基因分型平台鉴别出了肺癌的新型易感性位点。

6. 近日, 美国北卡罗来纳大学医学院的研究人员开发出一种高解析度的方法绘制出了吸烟导致的DNA受损。这项技术将帮助我们更好地理解吸烟带来的风险,以及它是如何导致癌症的出现,以及为什么烟民更容易患癌症,甚至是这些癌症如何被预防。这项研究已发表在近日的 PNAS 上。

7. 近日, Scientific Reports 杂志发表了一种新型NGS流程,可从数字化条形码加密单链文库的测序系统中捕获RNA探针靶向的DNA双链体,进而鉴定超低频率突变。 该方法 使用RNA探针靶向两条DNA链,将超灵敏单链库构建与条码纠错相结合。 研究人员在论文中表示, 该方法在生物医学和临床应用中对发现新型低频致病变体具有很大的潜力,并且可以为患者确定更多可行的治疗靶点。

8. 近日, 美国能源部基因组研究所(DOE JGI)为地球微生物多样性的发现迈出了决定性的一步。6月12日在线发表在 Nature Biotechnology 的文章报道了Nikos Kyrpides课题组发布的1003个系统发育多样化细菌和古细菌的参考基因组,这是迄今为止最大规模的一次微生物基因组数据发布。

9. 6月13日,《自然》子刊《Nature Genetics》上刊登了一项重量级研究——来自荷兰的一支团队通过分析比较大量的遗传信息,首次找到了与失眠风险有关的7条基因。这项研究表明,失眠不仅是心理上的问题,背后可能有着重要的生物学机理。

新发表文章

【新技术】

1. Fast STR allele identification with STRait Razor 3.0.Woerner AE et al.Forensic Sci Int Genet. 2017 Jun 1

【动物】

1. Leucine Differentially Regulates Gene-Specific Translation in Mouse Skeletal Muscle.Drummond MJ et al. J Nutr. 2017 Jun 14.

【植物】

1. Small RNA-Sequencing Links Physiological Changes and RdDM Process to Vegetative-to-Floral Transition in Apple.Guo X et al.Front Plant Sci. 2017 May 29

2. Variation of Soil Bacterial Communities in a Chronosequence of Rubber Tree (Hevea brasiliensis) Plantations.Zhou YJ et al.Front Plant Sci. 2017 May 29

3. Immunoprecipitation and High-Throughput Sequencing of ARGONAUTE-Bound Target RNAs from Plants.Carbonell A.Methods Mol Biol. 2017







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