Nat Commun丨黄佳良/陆发隆/戴建武合作发现基因表达空间特异性的增强子密码

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研究论文 。 该 研究 开发 了 eSpatial 算法 ，通过 整合 空间 基因表达和染色质可及性 等多组学 数据 ， 系统 揭示 了 不同 增强子 组合调控了 空间 特异性 基因表达。

eSpatial 算法 通过整合 空间 表观基因组与转录组数据， 实现 细胞类型鉴定、空间 区 域划分 及 增强子 空间活性鉴定 ， 从而 解码增强子 的空间 调控 机制 。 研究团队将 eSpatial 应用于 不同物种、不同组织的 空间 表观组学 数据集 分析， 包括小鼠胚胎和大脑 ， 以及人类黑色素瘤和乳腺癌 的肿瘤微环境样本 ，揭示了： 同一基因在不同空间区域可通过不同的增强子组合实现精确的表达调控 的规律 ， 并据此 提出 了 “ 增强子空间密码 （ spatial enhancer code ） ” 理论 模型 。 为验证 该 理论 的 普适 性，研究团队 整合了 VISTA 数据库、 Allen 原位杂交 （ ISH ） 和

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