正文
从进化史的角度看，健康与疾病是社会与生物协同进化的结果。在特定政治经济条件下，人以社会文化为媒介，与自然生态互动。人类与环境的复杂适应要求多基因间的协同变化，一般需要上万年时间，而单基因的性状变化可在千百年内完成，导致了人类在过去万年间的巨大变化。这方面的经典案例包括乳糖耐受性、镰刀血球贫血症与疟疾的研究，近期案例是德国犹太人（ashkenazi jews），这部分犹太人聪明绝顶，但多有基因病（主要由磷脂鞘存储混乱引起）。从1800年前后开始，因社会隔绝，犹太人被迫从事金融等高智商职业，刺激其神经鞘脂类结构的变化，促进智商发育，并因犹太教内部通婚而世代传承。同时，鞘脂类结构的变异又引发多种遗传病。高智商和遗传病是社会和生物协同进化的结果。经临床观察验证，磷脂鞘结构异变的生物结果（高智商和遗传病）彼此相关，但产生这个变异的原因（世代从事高智商工作刺激磷脂鞘结构变化并经由内部通婚强化）还只是一个假说
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协同进化理论目前处于假说阶段，由两部分组成：（1）社会历史变迁导致基因性状的变异；（2）变异的生物机理。第二部分可由分子生物学，尤其是生物考古对人类化石的DNA分析来探讨，但第一部分很难证实。另外，传统进化理论把社会当成环境的一部分，不把社会和自然作为影响人类进化的两个独立但相关的因素。医学人类学家认为，社会产生前后，人类遭遇的进化机制不同。产生前，是纯粹生态的进化机制，由偶然性和适应性控制，由创造性进化的跃迁和适应性进化的分化构成，循环往复。社会产生后，因为人类认知的特性，我们把想象变成现实，创造出社会，以应对自然生态。自然与社会两个客体共同影响人，即人、社会、自然的关系由人-工具（社会）-自然转变为自然-人-社会的三明治结构。目前，生物考古学正在建立人类基因在不同社会形态中的序列。
协同进化假说在两方面有解释力：（1）解释随人类社会的结构变迁（从狩猎采集到农业社会再到工业社会）人类疾病谱依次从寄生虫疾病
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，到流感和其他流行病如血吸虫病、鼠疫、黑死病等
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，再到心血管和慢性疾病、HIV/AIDS、耐药性肺结核及各种污染所致疾病
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。据此，医学人类学家提出discordance hypothesis，解释为什么当代人类疾病谱变得如此广阔和怪异：近两三百年来，人类社会历史变迁过于迅猛，远超过人类生物特性的变化，二者匹配出现问题，导致大量疾病的出现。（2）对人类纪元的讨论，即人类活动开始对地球生态与地理产生根本性改变的纪元。此概念还未被确认为一个地质纪年，但已引起诸多争议。
在embodiment和协同进化机制下，人体一方面有相同的生物构造和机理，另一方面也跟社会生活与生态环境相关，导致相同的生命过程体现出不同的身体表征。为更好地理解人类的疾病和健康，在现代生物学建立的universal biology 之上， 医学人类学还考虑特定人群因独特生活方式、饮食和生态环境而形成的local biologies（为保留其复数意味，本文沿用此概念的英文)
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为阐明local biologies 的概念，Lock研究了日本女性的停经现象。20世纪五六十年代, 停经开始被当成一种疾病。基于西方女性的样本，医生认为更年期综合征由雌性激素水平的变化引起，主要症状为盗汗和潮热（汉语翻译中借用了中医术语），如不加治疗，会诱发骨质疏松和心脏病。20世纪50年代以来，医学上普遍采用荷尔蒙调节治疗法，但会诱发子宫内膜癌；70年代后配以孕激素治疗，又会引发胸腺癌。美国国家癌症研究所资料显示, 自2002年许多妇女停止激素治疗后，胸腺癌的比率大幅度下降。《柳叶刀》杂志发表的一项研究表明，1991年~2005年，激素治疗在美国已造成1 000多人死于卵巢癌。2003年的一项研究表明，接受激素治疗的女性患痴呆症的可能性加倍。同年，北美停经研究协会发表声明，承认对停经尚缺乏有效知识，为减少盗汗和潮热症状的激素治疗应该少量且最好短期使用。这实际回到60年代激素调节治疗之前，即接受人类的自然衰老。
