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同年 11 月，与当时华南理工大学二年级的学生陈磊华一起开发了中国第一个全中文免费电子邮件系统(后者成立了邮件服务器系统coremail，现仍为网易邮箱服务，并拥有众多高校政府企业客户)。 1998 年 2 月，丁磊因为资金问题不得不将网易免费邮箱及163.net域名以约 120 万元卖给飞华网，而网易自己的邮箱以@yeah.net以及@126.com域名运营。
163.net在当时因为其耳熟能详的数字域名(拨号上网时使用的号码)成为了最受欢迎的互联网网站之一。不久后，飞华网又以 5000 万的价格将163.net出售给深圳新飞网，当时用户超越 150 万。一年后，几次易主的163.net宣布访问量突破一亿，注册用户超过 350 万。最终， 2000 年 9 月TOM在线以 4800 万美元收购163.net电子邮箱，成为当时中国互联网最大的一笔收购案之一。
不过， 163 这个名字最后还是回到了网易手上，163.net在被收购后渐渐淡出了人们的视线，而网易的163.com邮箱已经成为了现在最多用户的邮箱服务之一。
千禧年前后，当时的网络公司都开始向门户类网站进军，邮箱也成了各大网站争相抢夺的一块领地。 2001 年的时候，邮箱服务界开启了一股收费浪潮，以大容量、邮箱域名后缀为卖点向用户收取月租费。
现在看来，邮箱可以说是中国互联网产品中最早开始推出收费服务的。新浪邮箱还曾把免费邮箱的域名从@sina.com变成@mail.sina.com，鼓励用户付费，可是结果不尽人意 ，当时还有一位来自天津的律师因为不满新浪免费邮箱容量突然从 50 兆缩水为 5 兆，对新浪公司进行了起诉。 2002 年， 263 邮箱宣布收费，成为第一家全面收费的邮箱服务，其用户数却从 2000 万骤减至 59 万。
与此同时，在美国，被微软收购的Hotmail邮箱，雅虎邮箱以及Gmail等服务正在不断扩充邮箱容量，Gmail更是率先推出1G容量的免费邮箱，使得容量不再是邮箱用户需要担心的一个问题，用户也不再需要手动删除过多的邮件来管理自己的邮箱空间，而是将搜索的功能放大，此后各大邮箱服务也开始纷纷效仿。
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2002 年，腾讯发布QQ邮箱。 05 年腾讯收购张小龙创立的foxmail，当时最大的独立邮箱客户端。此后QQ邮箱发布多个重大更新，界面变得更简洁，功能更新颖。到 2008 年的时候，QQ邮箱已经成为全国使用人数最多的邮箱服务之一。作为QQ内捆绑的一个服务，让当时许多对互联网、甚至邮箱都一无所知的用户第一次接触到了邮箱，并且拥有了自己的第一个邮箱。
马化腾自己也曾说过：
“中国最早的一批网民不知道浏览器，不知道电子邮件，但都知道QQ，大家普遍认为上QQ就是上网。”
QQ邮箱不同于世界上任何邮箱服务的是，它开发了许多神奇的功能。 2010 年 9 月，QQ邮箱发布漂流瓶功能，让用户在邮箱里可以发送或读取匿名信息并且交友。这是第一次有任何一个邮箱服务加入了这样有趣的社交元素，这一功能现在也被沿用至微信等其他产品中。
