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面对来势汹汹的 3D 狂潮，科乐美其实没有坐以待毙。从N64（任天堂公司1996年发售的第三代家用游戏机）时代起，科乐美开始致力于游戏的3D化。但游戏精髓和3D技术的融合困难重重：「恶魔城」系列在PS2时代的两部作品均遭遇滑铁卢，「魂斗罗」系列的游戏模式更是否定了3D化的可能性。
《合金装备3》
与此形成鲜明对比的是，小岛秀夫的「合金装备」系列的3D化进程却异常顺利。这与小岛提出的策略密不可分：
游戏模式基本保留《合金装备2：固蛇》中已经完善的玩法，辅以少量充分利用3D效果的战斗，并借助3D技术增强游戏表现效果。
在3D技术尚不成熟的年代，这种「半3D 化」的思路在保留游戏精髓的基础上充分利用了技术进步的红利，成为一时的模仿对象。
《合金装备3:食蛇者》是合金装备系列的第三弹
在1997年美国亚特兰大E3大展上，科乐美凭借《合金装备索利德》（Metal Gear Solid）预告片收获无数掌声，玩家们惊呼「互动式电影时代」的来临。
虽然在此之前小岛秀夫就一直尝试在游戏中加入电影元素，但之前的硬件条件极大地限制了游戏电影化。PS平台此前也有如《生化危机》和《最终幻想Ⅶ》等将电影元素融入游戏制作的成功先例，但《合金装备索利德》达到的高度令它们难以望其项背。
小岛秀夫在游戏中大量借用电影中的经典镜头，游戏中画面的视点随主角的不同动作随时变换，再配合精彩剧情的过场动画，游戏的效果就像观看一部高成本电影。
《合金装备索利德》1997预告片
小岛秀夫本人期望《合金装备索利德》能够取得全球百万份的销售成绩，然而游戏发售后势如破竹，最终累计销量突破700万部，几乎是科乐美进入游戏业以来所取得的最好成绩。至此，「合金装备」系列正式成为科乐美20世纪90年代游戏的中流砥柱，小岛秀夫也逐渐掌握了游戏制作的话语权。
反战主义与人文关怀
单从游戏的可玩性与视觉体验角度欣赏「合金装备」系列无疑忽视了这部游戏的最大魅力，我们如果仔细体会剧情，则不难发现制作者的良苦用心。
纵观整个系列，反战思想贯穿始终。小岛秀夫曾不止一次地公开表示，游戏场景应该刻画得尽量真实，把人物受伤与死亡的场景更完整地呈现给玩家，以达到令玩家反思的效果。2007 年，在接受访谈时，他说：
「直接反对暴力的游戏不多见。在被殴打时，人会感到疼痛，脸也会变形，我想要把这些好好表现出来。不让玩家看到这些痛苦，他们就不会明白。即使只是游戏中的战斗，也要让玩家感到要为自己的行为负责。」
他确实遵循了这条原则。在系列第一作中，最高通关评价的其中一个指标是25击杀，这几乎是游戏通关的极限。玩家如果想要拿到高评价，就必须避免杀人。在3年后发售的第二作中，游戏引入了麻醉枪，使得通关0杀害成为可能。
除此之外，「合金装备」系列的剧情与同时期世界格局密不可分。
无论是《合金装备索利德》中对基因技术和核技术的反思，还是《合金装备2：自由之子》（2001）中关于人类在数字时代身份迷失和文化传承的讨论，抑或是《合金装备：食蛇者》（2004）中对爱国、忠诚和善恶的探寻，「合金装备」系列表达了制作人对世界和人类未来的思考，反映出当时的时代面貌。
我们不能苛求一款游戏能鞭辟入里地批判现实，但作为一款游戏，「合金装备」系列的思想达到了前所未有的高度，这是至今其他剧情简陋、生搬硬套的游戏无法比拟的。
衍生之作《合金装备：幸存者》中过去世界遗留下的巨大残骸
