专栏名称: 基因检测与解读
介绍基因检测新进展,探讨基因数据分析流程与方法,分享罕见病故事,科普基因知识,个人基因检测报告解读
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顶级遗传学杂志呼吁大家发表文章时变异的命名不要太随便

基因检测与解读  · 公众号  ·  · 2024-11-11 07:00

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HGVS 命名标准严格遵守。例如,我们增加了对额外 HGVS 格式的支持,包括 RNA r. )描述,这通常不是由其他命名法验证工具提供的(表 1 )。 VariantValidator 定期更新以处理更复杂的 HGVS 命名法格式,用户可以通过直接联系我们或在我们的 GitHub 页面上添加功能请求来请求添加新格式。响应技术需求,我们使 VariantValidator 兼容集成到组学平台。 VariantValidator 的核心引擎可以作为 Python 库安装,我们还开发了一个名为 VariantFormatter Python 模块,旨在直接集成到基因组学工作流程中。 VariantFormatter 使用自定义和本地 VariantValidator 函数来验证基因组变异描述( VCF HGVS ),并将它们映射到 RefSeq Ensembl 参考序列背景下的转录本( c. )和蛋白质( p.





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