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CRISPR-Cas9更容易发生脱靶突变吸人眼球,已导致一些CRISPR公司股票下降

生物谷  · 公众号  ·  · 2017-06-11 22:34

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科学家们总是承认CRISPR并不是完美的。计算机算法已被开发出来用于鉴定基因组上与向导RNA(gRNA)序列存在相似性的位点。迄今为止,已有研究提示着CRISPR技术的脱靶突变率通常是较低的,但是Mahajan解释道,“我们想要付出我们应有的努力来观察CRISPR-Cas9是否可能偶然地靶向其他的位点。”

Mahajan和他的同事们对来自他们的2016年那项研究中储存的组织样品的基因组进行测序,并且将它们与已发表的小鼠序列数据进行比较。在这些组织样品序列中存在的但在公共序列数据库中不存在的突变被鉴定为CRISPR介入导致的脱靶突变。

Mahajan团队对这些结果感到吃惊:两只接受CRISPR处理的小鼠发生的突变比预期中的多10倍。更令人担忧的是,在这些突变中,没有一种突变存在于利用计算机算法预测到的Cas9脱靶位点之内。

Mahajan告诉《科学家》杂志,“这些全基因组序列似乎在未被预测的区域中发生突变。这提示着利用体外培养的细胞开展的实验可能并不能较好地预测当被注射到整个有机体内时,CRISPR蛋白是如何作出表现的。”

Mahajan说,利用预测性算法仅在基因组的蛋白编码区域中寻找潜在的脱靶位点,可能会遗漏一些突变。非编码区域“在调节基因和调节细胞中发挥着重要的作用”,但是他承认,“我们迄今为止不能够预测在这些区域中的突变如何可能影响整个有机体。”他说,尽管这些小鼠存在新的突变,但是在他的研究中,它们看起来很正常。

Mahajan提醒道,“这是一项非常小型的针对性研究:探究了小鼠中的单个基因。我们需要开展更多的研究来理解脱靶效应如何发挥作用,以及它如何在不同的情形下出现。”





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