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Nature Genetics丨长期新冠的全基因组关联研究

BioArt  · 公众号  · 生物  · 2025-06-08 10:10

主要观点总结

本文介绍了长期新冠(Long COVID)的临床表现、发生率、潜在机制以及全基因组关联研究。研究发现FOXP4基因变异与长期新冠的发生显著相关,该变异可能通过调控肺部细胞功能和免疫反应,在特定病毒株和人群背景下增加发病风险。

关键观点总结

关键观点1: 长期新冠是COVID-19感染后持续存在的症状,临床表现多样,包括疲劳、肺功能障碍等。

长期新冠的发生率在10%至70%之间,其潜在机制可能涉及血清素系统紊乱、线粒体功能障碍等。

关键观点2: FOXP4基因变异与长期新冠的发生显著相关,该发现独立于FOXP4在重症新冠中的作用。

FOXP4基因在肺功能调节中起关键作用,其变异可能导致肺部功能障碍,进而引发长期新冠。

关键观点3: 研究进行了大规模的全基因组关联研究(GWAS),共纳入15,950例长期新冠患者和近190万名对照个体,以确定长期新冠的关键遗传机制。

研究发现,FOXP4基因变异是长期新冠的独立遗传风险因子,其通过调控肺部细胞功能和免疫反应增加发病风险。


正文

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此前发现,病毒入侵及免疫相关通路与新冠感染的严重程度密切相关。为了进一步揭示长期新冠的发病机制,研究团队在来自 19 个国家的 33 个队列中开展了大规模全基因组关联研究 GWAS ,共纳入 15,950 例长期新冠患者和近 190 万名对照个体。

FOXP4 基因变异与长期新冠的关联性

首先, 研究 人员 对来自 16 个国家的 24 项长期新冠相关 GWAS 进行荟萃分析,覆盖多种病例与对照的定义,共纳入 6,450 例长期新冠患者和 1,093,995 名对照。分析结果显示,位于 6 号染色体上的 FOXP4 基因区域变异位点 rs9367106-C 与长期新冠显著相关,并在多个独立队列中得到了验证。进一步分析发现,该变异与 FOXP4 上游约 30kb 区域内的多个高度连锁的变异位点相关,提示该区域可能为调控性致病区域。研究 指出, rs9367106-C 等位基因在不同人群中的频率差异较大,从非芬兰欧洲人群的 1.6% 到东亚人群的 36% 不等。虽然研究样本以欧洲血统个体为主,但由于该等位基因在东亚和美洲混合人群中频率更高,因此在这些人群中也观察到显著的关联信号。 此外 ,变异位点 rs12660421-A 可上调 FOXP4 在肺和下丘脑中的表达,并与长期新冠 GWAS 信号共定位,提示其可能参与疾病的发生机制。 FOXP4 是一种广泛表达的转录因子,在肺内皮细胞和免疫细胞中表达尤为明显。既往研究也发现 FOXP4 变异与 COVID-19 住院风险相关,且这些变异与 FOXP4 在肺组织中的表达数量性状位点 eQTL 共定位,提示 FOXP4 可能在新冠的多个阶段均具有作用。分析 表明,在非急性期感染者中, FOXP4 表达水平升高与长期新冠风险增加显著相关,而在急性感染期则未观察到这种关联。这一发现提供了遗传研究之外的独立支持,强化了 FOXP4 表达上调可能促发长期新冠的结论。

长期新冠的关键遗传机制

接下来,研究 发现, FOXP4 在肺组织中主要表达于 2 型肺泡细胞和粒细胞,这两类细胞在免疫应答和肺组织修复过程中具有关键作用。通过精细定位分析,研究确定 rs9381074 为最具可能性的致病变异位点。该变异位于肺部活跃染色质区域,不仅存在多种转录因子 (尤其是 FOXA1 的结合证据,还具有






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