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《细胞》子刊:攻克两大瓶颈,突破性测序技术成功测定人类tRNA化学修饰

学术经纬  · 公众号  · 医学  · 2025-05-16 16:31

主要观点总结

文章介绍了转运RNA(tRNA)在生物学中的重要性,包括其在蛋白质合成、翻译和基因表达等过程中的作用。文章重点介绍了人类tRNA携带的化学修饰以及这些修饰在疾病过程中的作用。文章还提到了在绘制人类tRNA化学修饰图谱时面临的挑战以及最新技术MapID-tRNA-seq的开发和应用,该技术能够克服这些挑战并实现高精度分析。文章最后讨论了这项技术在揭示细胞代谢和癌症中的潜在作用方面的应用。

关键观点总结

关键观点1: 转运RNA(tRNA)在生物学中的核心功能和调控作用。

tRNA作为载体将氨基酸转运至核糖体,参与蛋白质合成。近年来,研究发现tRNA还对翻译、基因表达等过程起到了调控作用。

关键观点2: 人类tRNA携带的化学修饰及其重要性。

人类tRNA携带多达57种化学修饰,这些修饰在疾病过程中发挥重要作用,特别是在癌症和线粒体疾病中。

关键观点3: 绘制人类tRNA化学修饰图谱的挑战及新技术MapID-tRNA-seq的开发。

由于人类tRNA化学修饰的复杂性,科学家们面临着两大挑战:逆转录酶的提前终止和tRNA基因冗余导致的错误识别。MapID-tRNA-seq技术通过应用进化型逆转录酶RT-1306和MapID注释系统解决了这些问题。

关键观点4: MapID-tRNA-seq技术的应用及在揭示细胞代谢和癌症中的潜在作用。

利用MapID-tRNA-seq技术绘制乳腺癌细胞系和良性乳腺细胞系中的tRNA化学修饰和表达图谱,揭示了癌细胞中线粒体活性的下降和翻译调控的变化。


正文

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A和m 3 C修饰,验证了识别修饰位点的可靠性。



▲研究示意图 (图片来源:原始论文[1])


综合这两项策略,MapID-tRNA-seq技术为探索人类tRNA化学修饰的调控提供了全新方案。研究团队利用MapID-tRNA-seq绘制了两种乳腺癌细胞系和良性乳腺细胞系中的tRNA化学修饰和表达图谱,发现与良性乳腺细胞系相比,癌细胞系中的线粒体tRNA表达明显下调,这一变化可能反映了癌细胞向糖酵解的代谢转变,揭示了癌细胞中线粒体活性下降的翻译调控。


综上,MapID-tRNA-seq技术的出现有效克服了人类tRNA修饰检测的技术瓶颈,并且揭示了化学修饰在细胞代谢和癌症中的潜在作用,为理解生命基本过程与疾病机制提供了有力的新工具。


点击文末“阅读原文”,可阅读 Cell Chemical Biology 科学编辑对周慧青教授的专访。


参考资料:

[1] M.L. Tepe et al., MapID-based quantitative mapping of chemical modifications and expression of human transfer RNA. Cell Chemical Biology (2025). DOI: 10.1016/j.chembiol.2025.04.003


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