Nature 一周论文导读 | 2025年3月13日

（导读 阿金）噬菌体使用不同机制来逃避抗噬菌体防御系统，ΦKZ类巨型噬菌体组装成蛋白质样核状区室，将拮抗性宿主核酸酶排除在外，同时内化DNA复制和转录机制。本研究揭示了一套进入系统，包含了在核形成噬菌体中高度保守的蛋白质以及额外的货物特异性作用因子。研究人员明确了5个不同噬菌体核定位蛋白质的进入需要同一因子Imp1的不同界面，结果提出了一套核心进入系统，包括Imp1，Imp3与Imp6，随着Imp1不同界面准许转运通过蛋白质晶格。 [ 论文详细信息 ]

（导读 领研网）肿瘤异质性让免疫系统难以干预所有的肿瘤细胞。本研究揭示了肿瘤细胞在基因剪接过程中产生的系统性错误：当细胞的“分子剪刀”失控时，会产生大量异常的基因连接片段，这些“基因拼图错误”编码的蛋白质片段会在多种癌症中形成高度保守的公共新抗原。研究人员捕捉出94个高频出现的异常剪接事件，其中GNAS和RPL22剪接错误尤为普遍，当工程化T细胞遭遇携带GNAS剪接错误的肿瘤细胞时，能在72小时内清楚80%的癌细胞。 [ 相关报道："分子剪刀"失控催生癌症"通用抗原" ]

（导读 领研网）个性化肿瘤疫苗（PCV）可生成循环的免疫应答以对抗可预测的新抗原。本研究展开I期临床试验测试III或IV期透明细胞肾细胞癌患者的新抗原靶向PCV接种效果，疫苗在三周内诱导了免疫反应，同时疫苗诱导的T细胞数量平均增加了166倍。体外分析表明这些T细胞对患者自身的肿瘤细菌具有活性。接下来还需要展开更多临床试验确认疫苗有效性以及其他治疗潜力。 [ 相关报道：BioNTech癌症疫苗登上 Nature ，让晚期肾癌患者无癌生存超3年 ]

（导读 领研网）组织驻留记忆CD8 ⁺ T细胞（TRM）在适应性免疫反应中起关键作用。本研究利用空间转录组学并开发了一个计算框架来表征指导小肠TRM细胞分化的细胞及配体-受体相互作用。此外还开发了一种多重化、光学编码的空间CRISPR敲除实验，在体内环境中研究免疫细胞分化过程，从而扩展了小肠T细胞分化的模型。 [ 相关报道：TGFβ-CXCL9/10介导肠道组织驻留记忆T细胞的空间特异性 ]

（导读 领研网）杜氏肌营养不良症被描述为“无法逆转的绝症”。本研究发现一种转录适应机制：当主控基因的mRNA出现致命错误，细胞将其识别并通过无以介导的mRNA降解将错误mRNA清楚，随后触发染色质结构级联反应，激活备份基因utrophin（ UTRN ）的转录开关。以此为基础，研究人员开发出两种操控该系统的“分子开关”，通过反义寡核苷酸人为制造可控的mRNA错误，精准激活补偿程序；插入自剪切核酶基因疗法，让正常mRNA定向降解，持续激发细胞自救。 [