正文
张泽民院士团队
利用大量单细胞测序数据
构建
了涉及
716个患者1223个样本24种癌症类型的人类泛癌
NK细胞
图谱,共计
16万个高质量NK细胞。
[2]
该研究
首次在泛癌水平系统鉴定到了
13个NK细胞亚群,发现可通过RGS1确定肿瘤组织浸润NK细胞亚群
。研究进一步探究了不同亚群在肿瘤微环境中的作用,
确定其与预后不良和免疫治疗耐药性有关且在黑色素瘤和白血病中得到了验证。
图:人类泛癌
NK细胞
图谱
构建示意图。
[2]
从上述案例可以看出,准确全面描绘
NK细胞
异质性通常需要大规模单细胞测序来支撑。
因美纳的
ISCP方案具有超高细胞通量优势,单个样本单次反应最高可处理10
万个细胞(
T100
试剂盒)
。
高细胞通量
设计可以
捕获
更多
NK细胞
等关键免疫细胞,
为全面理解
血液及肿瘤中的免疫
细胞异质性
提供稳定、准确的数据,为探索新的生物标志物和治疗靶点提供助力。
目前
,
ISCP
试剂盒
分为
4种规格T2、T10、T20、T100,可最高处理2000个细胞/样本~10万个细胞/样本,能够对任何样本规模进行简单、高效的测序,
发现更多罕见和低丰度免疫细胞,提高分析效率。
图:
ISCP
试剂盒配置
。
来源:因美纳官网
虽然市场上已有的单细胞替代解决方案可以做到每张芯片高达
8万个细胞的通量,但其高昂的成本限制了很多类似单细胞研究项目的开展。
在高细胞通量的前提下,
ISCP降低了单细胞制备及研究成本。
据因美纳官方资料显示,
与
现有
的单细胞替代解决方案相比,
ISCP能够以
相同成本处理
5
倍的细胞
量
[3]
,识别
更多的
独特细胞类型
,
可
提供目标组织更为详尽和全面的单细胞数据,捕获其他方法
易
遗漏的细胞类型,
例如罕见的某
NK细胞
亚群
。
同时,
ISCP无需复杂/昂贵的微流控设备,减少了前期设备投入。
图:与现有单细胞检测方法
(A)相比,
ISCP
(B)处理外周血单核细胞匹配样本识别了
5
倍的细胞
量和
2
倍的独特细胞类型
。
[3]