专栏名称: 生信杂谈
生物信息学;生物信息;计算机辅助药物设计;测序分析;Python;R;机器学习;论文写作;网站制作;LOL;dota2。
目录
相关文章推荐
广东民生DV现场  ·  中山发生一起伤人事件,犯罪嫌疑人已被刑拘 ·  5 小时前  
51好读  ›  专栏  ›  生信杂谈

#分子模拟#Gromacs如何添加非标准残基进入力场

生信杂谈  · 公众号  ·  · 2017-09-07 15:21

正文

请到「今天看啥」查看全文


如果你有新的残基想要放入已存在的力场文件中,从而使得可以使用已经存在pdb2gmx文件或者修正已经存在的一个,这有几个文件你需要进行修改。当然你需要仔细的查看手册中对与格式的要求。具体下来有如下几步:


  1. 在你选择的相应力场中的 .rtp 文件中增加残基,你可以copy已经存在的残基,重命名以后在进行修改,或者你可以使用额外的拓扑生成工具来适应.rtp文件的格式。







请到「今天看啥」查看全文