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看人家博士生做科研真是费劲!这中山大学第一附属医院的14.3分线粒体自噬的SCI文章,可还有那么点儿...

实验万事屋  · 公众号  · 科研  · 2025-05-18 20:00

主要观点总结

本文讲述了中山大学第一附属医院博士生发表在Bone Res期刊上关于膝关节骨关节炎的研究。研究中发现PARP12在线粒体自噬及OA进展中的关键作用,探讨了PARP12的表达与线粒体自噬之间的关系以及其在OA中的具体作用机制。

关键观点总结

关键观点1: 文章主要关注膝关节骨关节炎(OA)的研究,特别是线粒体自噬在其中的作用。

通过mRNA测序发现PARP12在OA软骨受损区域表达显著上调。

关键观点2: 研究重点集中在PHC细胞中PARP12的表达验证,发现炎症刺激上调了PHC细胞中PARP12的表达,但下调了自噬能力。

PARP12的亚细胞结构定位主要在细胞质中,并与p62和线粒体标志共定位。

关键观点3: 通过MIA诱导的大鼠OA模型进一步验证了PARP12在OA中的表达,发现其与OA的表型有紧密联系。

研究发现PARP12的敲减和过表达对软骨细胞凋亡和线粒体自噬有重要影响。

关键观点4: 文章探讨了PARP12的作用机制,发现其与ISGylation、MFN1/2和IRF1等关键蛋白有关。

PARP12通过基于ISG15的MFN1/2的ISGylation抑制PINK1/Parkin依赖性线粒体自噬。

关键观点5: 文章最后讨论了PARP12抑制剂XAV-939对OA进展的影响,并通过大鼠模型验证了体内PARP12过表达对线粒体自噬和软骨降解的影响。

总体来说,这篇文章探讨了从PARP12的上游IRF1到下游PINK1/Parkin依赖性线粒体自噬的整个过程,但在验证过程中存在一些逻辑上的欠缺。


正文

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):



那么ISG15在这之间又参与了什么样的作用呢?他们首先通过敲减ISG15分析其在OA中的功能,结果发现ISG15可以抑制OA中PINK1/Parkin介导的线粒体自噬。而在敲减了ISG15的细胞中,MFN1/2的SUMO化及泛素化,有了明显的增加。也就是说,ISG15很可能会抑制PHC中线粒体蛋白的泛素化和SUMO化。PARP12与ISG15的互作,促进了ISG15的表达。而ISG15的表达增强,则促进了MFN1/2的ISGylation,并抑制了其SUMO化和泛素化。而MFN1/2的ISGylation增强了其表达,从而抑制OA中PINK1/Parkin介导的线粒体自噬:



PARP12的下游已经确定了,那是什么诱导了PARP12的转录表达呢?由于IL-1β可以激活PARP12的表达,他们又通过JASPAR数据库进行了进一步的分析,结果发现炎症相关的转录因子IRF1可能参与激活了PARP12的转录。他们通过敲减IRF1后过表达PARP12来分析了两者的上下游关联性,以此确定了IRF1抑制PINK1/Parkin介导的线粒体自噬并促进软骨变性,而PARP12可以逆转这个过程( 实际上这一系列的验证,并不严谨,由于这里的验证命题并没有明确地将IRF1激活PARP12作为验证的命题,而是分析了两者表达之间的关联性,这样就很容易犯肯定后件的逻辑谬误,课题也因此不够严谨。不熟悉命题的外延或内涵,以及肯定后件逻辑谬误的话,可以看看《科研的推理和逻辑》和《列文虎克读文献》 ):



鉴于PARP12对PARP12于OA的影响,他们找出了一个PARP12抑制剂,试图通过药理学来阻止OA进展。而找到的这种PARP12抑制剂,XAV-939可以通过靶向PARP12,促进PINK1/Parkin介导的线粒体自噬并抑制软骨降解:



接着,他们通过大鼠中过表达PARP12,来分析了体内PARP12过表达,对于线粒体自噬预计软骨降解的影响:



最后就形成了这样的示意图,IRF1介导的PARP12上调,而PARP12通过基于ISG15的MFN1/2的ISGylation,减轻MFN1/2的泛素化和SUMO化,抑制PINK1/Parkin依赖性线粒体自噬,从而促进软骨降解:



总的来说这篇文章研究的内容线拉得很长,从PARP12的上游IRF1,一直到MFN1/2的ISGylation以及下游的PINK1/Parkin依赖性线粒体自噬。但在验证的过程中,其实还是有一些欠缺的,也就是并没有围绕着蛋白间的结合,或者转录因子与启动子的结合,来进行验证,这样就会造成肯定后件的逻辑谬误( 文献验证过程中,严谨是比较重要的一个环节,而确定分析验证的命题则更为重要,通过这个环节,可以确定验证的方法及技术,否则就会产生一定的逻辑漏洞,比如这里的验证,可以通过突变PARP12与ISG15的结合位点来进行验证,突变PARP12启动子上IRF1结合位点来进行验证,这样就会更合理。 )。好了,今天就先策到这里吧,有兴趣的话可以看看原文,祝你们心明眼亮。







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