主要观点总结
这篇文章介绍了清华大学刘万里团队在Cell大子刊Immunity上发表的一篇关于抗体分泌细胞(ASC)的B细胞中IgG1的mRNA的聚腺苷酸化和m6A甲基化修饰的研究。研究针对Ighg的mRNA上d3'UTR的m6A甲基化展开,通过验证假设,发现YTHDF1在维持Ighg mRNA稳定性方面扮演重要角色,并与系统性红斑狼疮(SLE)有关。
关键观点总结
关键观点1: 文章主要研究了IgG1的mRNA的聚腺苷酸化和m6A甲基化修饰对IgG抗体的作用。
文章中介绍了B细胞利用表面的BCR识别抗原并启动信号传导的过程,以及IgH的两种形式mem IgH和sec IgH的转换。
关键观点2: 研究假设Ighg的mRNA上d3'UTR的m6A甲基化可能影响IgG的表达,并通过验证假设展开研究。
文章中提到了假设的提出、验证、迭代的过程,以及如何通过CRISPR工具定向去除m6A甲基化的方法。
关键观点3: 研究发现YTHDF1在维持Ighg mRNA稳定性方面扮演重要角色,并影响IgG抗体产生。
文章通过RNA测序、荧光定位等技术手段,证实了YTHDF1与Ighg mRNA的稳定性关系,并指出YTHDF1在SLE患者中的高表达情况。
关键观点4: 文章最后探讨了YTHDF1作为SLE治疗潜在治疗靶点的可能性。
文章通过单细胞测序等手段,发现SLE患者的浆母细胞中YTHDF1的表达差异,并指出使用YTHDF1抑制剂可以降低IgG抗体的产量。
正文
)。结果发现在m6A1939位点擦除m6A修饰后,明显降低了Ighg1 mRNA的丰度。也就是说m6A1939位点,在体内和体外介导Ighg mRNA的稳定性,YTHDF1则通过结合m6A1939,增强了Ighg1 mRNA的半衰期:
而荧光定位也发现,Ighg1的转录本与YTHDF1蛋白,在细胞核中存在着共定位。YTHDF1主要在ASC的细胞核中,发挥协调Ighg1 mRNA稳定性的作用,从而影响IgG抗体产生:
ASC细胞产生IgG抗体,与SLE(系统性红斑狼疮)有一定的关系。所以他们接着就分析了SLE患者的测序数据,结果发现SLE患者的YTHDF1 mRNA表达高于正常组。而在IFN-K治疗后,患者的YTHDF1表达显著降低:
通过单细胞测序(
下图的UMAP图就是单细胞测序的结果,就是通过不同的基因表达,形成多主成因分析,并进行降维,展示出不同的细胞亚群,不清楚的话,可以去看看《夏老师带你读文献》和《列文虎克读文献》
),他们也发现在B细胞亚群中,SLE患者的浆母细胞显着增加。YTHDF1在浆母细胞中的表达差异高于其他m6A相关基因。而在体外的SLE模型中使用YTHDF1的抑制剂后,降低了OVA特异性IgG抗体的滴度。也就是说,YTHDF1可以作为SLE治疗的潜在治疗靶点:
最后就形成了这样的示意图,形成sec Ighg的核定位剪接中间体Ighg,在d3′UTR带有m6A位点,这个位点被YTHDF1识别,并维持其mRNA的稳定性。在SLE患者中也有YTHDF1高表达的ASC亚群,会产生大量抗体。通过CRISPR定点清除Ighg的m6A甲基化,或抑制YTHDF1,都能降低IgG抗体的产量:
这篇文章虽然做的是m6A甲基化,看上去挺不出彩的一个课题。但他们从寻找Ighg1的不同转录本上的3'UTR位置上m6A甲基化位点,到使用CRISPR进行特异性的m6A甲基化清除,都做得相当到位。如果你正巧也在做m6A甲基化的课题,可以考虑看看这篇文章。好了,今天就先策到这里吧,有兴趣的话可以看看原文,祝你们心明眼亮。
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