#可视化#Pymol 选择速查手册

正文

请到「今天看啥」查看全文

color blue, all
#所有颜色标记为blue
color blue, * hide hydro
#所有氢原子都隐藏
hide h. show spheres, hetatom
#所有定义为HETATOMS的原子
show spheres, het

特征选择

—匹配参数选择—	—短字符—	—例子和解释—
symbol	e.	一到两个化学特征字符 select polar,symbol O+N
name	n.	最高4个字符的蛋白或者核酸原子 select carbons,name CA+CB+CG+CD
resn	r.	残基名 select aas, resn ASP+GLU+ASN 核酸名 select bases,resn A+G
resi	i.	残基编号 select mults10,resi 1+10+100``select nterm,resi 1-10
alt	alt	alternate-conformation-identifier-list select altconf,alt A+""
chain	c.	选择相应的链 select firstch,chain A
segi	s.	选择片段特征 select ligand,segi lig
flag	f.	从0到31的单整数 select f1,flag 0
numeric_type	nt.	单个整数 select typel, nt. 5
text_type	tt.	type-string select subset,text_type HA+HC
id	id	单整数外部索引 select idno,id 23
index	idx.	单整数内部索引 select intid,index 11
ss	ss	二级结构 select allstrs,ss H+S+L+""

数字选择表

—数字选择—	—短字符—	—参数和例子—
b	b	beta因子 select fuzzy,b>10
q	q	占有率值 select lowcharges,q>0.50
formal_charge	fc.	形成电荷值 select doubles,fc.=-1
partial_charge	pc.	部分电荷值 select hicharges,pc.>1

# 例子

请到「今天看啥」查看全文