专栏名称: 生信杂谈
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#分子模拟#VMD粗粒化显示插件Bendix简单介绍

生信杂谈  · 公众号  ·  · 2017-08-24 09:17

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官方教程

这里对官方显示教程做一个简单的介绍:
首先下载官方示例包:http://sbcb.bioch.ox.ac.uk/Bendix/data/tutorial_files.zip
其中包含pdb文件(PDB ID:1PV7)和一个分析文件(pdb)以及一个分析轨迹文件(dcd)

1.VMD中一般螺旋表示

首先我们可以把背景设置为白色 VMD Main > Graphics > Colours ,选择 Display ,设置 Background 颜色为8 white

加载 1PV7_LacY.pdb。通过 Graphics >Representations 设置为下图所示:







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