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测序周报 · 资讯篇:顶级列表!人类基因组中10大热门基因出炉!

测序中国  · 公众号  ·  · 2017-11-25 18:06

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时髦基因?

从2002年第一次公布了人类基因组草图之后,NLM开始系统性地将“基因参考功能”(GeneRIF)添加到论文中。这种注释一直延伸到了20世纪60年代,其中也采用了其它数据库来帮助填写细节。但这并不是一个完美的策划记录。NLM科学家Terence Murphy表示,这个数据集背景很多,2002年以前发表论文的取样可能存在一些偏差。这意味着一些基因被过度重视,而一些基因可能被错过了。

需要注意的是,PubMed记录揭示了几个不同的历史时期,其中基因相关的论文倾向于关注特定的热门话题。 例如,在20世纪80年代中期之前,许多基因研究以血红蛋白为基础。1985年以前,人类遗传学研究中有超过10%的研究是关于血红蛋白的。

不同时期热门基因 来源:Peter Kerpedjiev/NCBI-NLM

上世纪40、50年代,Linus Pauling和Vernon Ingram两位诺贝尔奖获得者开创性地从分子层面发现异常的血红蛋白(haemoglobin)会引发镰状细胞病(sickle-cell disease)。而此时许多研究人员还在Linus Pauling和Vernon Ingram早期工作的基础上展开研究。1962年,Max Perutz也因其在血红蛋白三维结构上的成就而获得诺贝尔化学奖。

来自美国国立卫生研究院的Alan Schechter教授认为,对血红蛋白基因的研究开启了从分子水平解析疾病的大门。他表示,在上世纪70年代和80年代初,这类基因是血液疾病、遗传学会议的一个讨论焦点。但是,随着测序和DNA操控技术的发展,科学家们开始关注其他基因和疾病,例如艾滋病。

在1983年HIV病毒被发现之前,已经有临床医生发现这一奇怪的患病模式,David Klatzmann回忆道,我对这些患者体内没有T4细胞感到十分震惊。在细胞培养实验中他发现,HIV似乎选择性地感染和破坏T4细胞,它是免疫系统T细胞的一个组成部分。但问题是:病毒如何进入细胞的呢?

Klatzmann推断,CD4+T细胞表面的蛋白是HIV病毒感染入侵的关键受体。事实证明,他是对的。1984年12月,他发表了相关研究成果。来自伦敦癌症研究所分子病毒学家Robin Weiss等人都提出的类似的观点。 在三年内,CD4成为研究最火热的基因,也是生物医学文献中报道最高的基因,占了NLM所有标签的1-2%,也大大促进了免疫学的发展。

15分钟热度: GRB2

到1990年初,TP53开始进入大家视角 。但是在它爬到人类基因研究阶梯的顶端之前,一个名为GRB2的基因已经占据了科学家视线多年。

当时的科学家们更热衷于研究与细胞通讯有关的特定蛋白质相互作用。由于细胞生物学家Tony Pawson的开创性工作,科学家们知道一些小的细胞内蛋白质含有一个称为SH2的模块,可以与细胞表面的活化蛋白质结合并将信号传递给细胞核。 1992年,耶鲁大学医学院的生化学家Joseph Schlessinger发现, GRB2基因 编码的蛋白含一个SH2结构域以及两个参与细胞生长存活的结构域。 在某种程度上, GRB2是开启信号转导研究的热门分子

此后其他研究人员很快就填补了空白,开启了信号转导的研究领域。然而尽管许多其他细胞信号传导组件陆续被发现,并最终延伸到了癌症,自身免疫性疾病,糖尿病和心脏病的治疗上去,但是GRB2依然处于顶端位置,并且在20世纪90年代后期成为三年的热门基因。







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