正文
由于Pho87是膜蛋白,研究人员便试着通过分离裂解液中的膜组分来浓缩。他们假设,在细胞破碎过程中提高盐浓度可保护Pho87免于降解,并刺激膜组分沉淀,从而有助于Pho87的富集。基于此,他们尝试了不同浓度的乙酸铵和不同的孵育时间,发现在1 M乙酸铵中孵育2小时可明显改善Pho87的沉降。
大家都知道,样品煮沸可能引起膜蛋白的聚集。同时,样品裂解液中SDS的存在可能使蛋白更容易被蛋白酶水解。事实上,即使蛋白酶抑制剂存在,研究人员还是无法在细胞裂解液中检测到全长的Pho87条带。为了避免煮沸并确保蛋白酶迅速降解,他们采用了包含SDS和高浓度尿素的样品缓冲液。
利用这种方法,研究人员检测了汉逊酵母的一些蛋白,包括Pho87、Sup35、Pmr1、CPY、Gas1、Tpd3和微管蛋白,以及酿酒酵母的一些蛋白,包括Sup35、Sup45、Gas1、Hsp104、Rnq1和微管蛋白,并将实验结果与常规方法进行了比较。
他们发现,与常规方法相比,新方法在膜相关蛋白(Pho87、Pmr1和Gas1)以及Tpd3和微管蛋白上有着更好的表现。Tpd3和微管蛋白的沉淀可能是由于它们与纺锤体极体的相互作用。同时,Tpd3的相当一部分位于细胞核中,这可能也有助于其沉淀。作者认为,将沉淀的蛋白溶解在含尿素的缓冲液中而不煮沸,大大改善了蛋白质的检测,特别是Pho87。
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