首次！纳米孔测序让流感病毒终于“无所遁形”| Nature

中国生物产业信息平台 · 公众号 · · 2018-04-24 16:56

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The influenza virus is the first RNA virus to have been sequenced in its original state.Credit: Dr. Gopal Murti/Getty

4月12日，这项研究的领导者、美国疾病控制和预防中心（CDC）的微生物学家John Barnes在给bioRxiv服务器（生命科学领域专有的预印本文献库）的预印本（a preprint posted）中介绍了这项工作，他说：“我们第一次可以真正开始观察基因组在其原始状态的本质，这确实开始开辟了很多可能性。”

1 变革前的“RNA测序”

RNA的化学性质类似于它的”近亲”——DNA。在细胞生物中，它充当DNA编码基因和蛋白质之间的中介，并在细胞中执行其他任务。但许多病毒（包括脊髓灰质炎病毒、埃博拉病毒以及普通感冒病毒）将其遗传信息存储为RNA，而非DNA。

据Barnes介绍，几乎所有的“RNA测序”都使用一种叫做逆转录酶的病毒酶，它通过将RNA复制到“序列友好”（sequencer-friendly）的DNA链中完成测序，而这种传统的“RNA测序”技术自20世纪70年代被发明以来就未改变过，这一技术缺陷也导致没有人对上述病毒的RNA基因组进行直接测序。