专栏名称: 生信杂谈
生物信息学;生物信息;计算机辅助药物设计;测序分析;Python;R;机器学习;论文写作;网站制作;LOL;dota2。
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gtf格式的基因注释文件转为bed格式.

生信杂谈  · 公众号  ·  · 2017-06-28 23:59

正文

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使用格式如下:

perl ./gtf2bed.pl gtf文件 输出文件名

脚本下载地址: https://github.com/kubranarci/gtf2bed

例如: gencode19版本的长非编码RNA的gtf注释文件转bed6格式:







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