专栏名称: 生信宝典
生物信息分析入门、晋级和经验分享。Linux、R、Python学习教程;高通量测序数据分析学习教程;生信软件安装教程。所有内容均为原创分享,致力于从基础学习到提高整个过程。
目录
相关文章推荐
生信菜鸟团  ·  【QuPath】Multiplexed ... ·  2 天前  
生信菜鸟团  ·  UCSCXena 数据库 ·  4 天前  
生信人  ·  又出新热点啦!10.3/Q1=网络毒理学+分子对接 ·  18 小时前  
生物学霸  ·  张文宏,受聘理工大学 ·  2 天前  
51好读  ›  专栏  ›  生信宝典

视频 | 这个为生信学习打造的开源Linux/Bash教程真香!!!

生信宝典  · 公众号  · 生物  · 2025-06-03 21:00

正文

请到「今天看啥」查看全文


2.1 文件属性和可执行属性

2.1.1 文件属性

2.1.2 可执行属性

2.2 PATH和path,傻傻分不清

2.2.1 小事也不能忽略

2.3 软件安装的几种传统方式

2.3.1 系统包管理器安装

2.3.2 下载二进制文件

2.3.3 源码编译安装

2.3.4 Python包的安装

2.3.5 Anaconda的两个福利

2.3.6 R和R包的安装

2.3.7 Perl包的安装

2.4 Conda安装配置生物信息软件

2.4.1 Conda安装和配置

2.4.2 Conda基本使用

2.4.3 Conda的channel

2.4.4 创建不同的软件运行环境

2.4.5 移除某个conda环境

2.4.6 Conda配置R

2.4.7 Conda环境简化运行

2.4.8 Conda环境备份

2.4.9 Conda环境导出和导入

2.4.10 Conda软件安装 core dump error/Segment fault/段错误 怎么办

2.4.11 Conda为什么越来越慢?

2.4.12 Conda是如何工作的

2.4.13 Conda哪一步慢?

2.4.14 如何提速Conda

2.4.15 下载提速

2.4.16 使用conda-pack直接从已经安装好的地方拷贝一份 (同一操作系统)

2.5 Docker安装

2.5.1 Docker能做什么

2.5.2 Docker的几个基本概念

2.5.3 安装和配置

2.5.4 Docker用户权限

2.5.5 Docker试用

2.5.6 Docker系统基本操作

2.5.7 使用Dockerfile自动构建镜像

2.5.8 Docker的特征

2.5.9 Docker使用注意

2.6 Makefile知识

2.6.1 参考

3 Linux神器

3.1 正则表达式替换文本随心所欲

3.2 awk-生信分析不可缺少

3.2.1 awk基本参数解释

3.2.2 awk基本常见操作

3.2.3 awk糅合操作 - 命令组合体现魅力

3.3 SED命令 - 文本替换舍我其谁

3.3.1 sed基本参数解释

3.3.2 常见操作

3.4 VIM的使用

3.4.1 初识VIM

3.4.2 VIM中使用正则表达式

3.5 有了这些,文件批量重命名还需要求助其它工具吗?

3.5.1 简单重命名

     rename演示

3.5.2 复杂重命名






请到「今天看啥」查看全文