专栏名称: 生信百科
依托高校科研平台,面向生物信息科研工作者。生物信息学习资料;常见数据分析技巧、流程;公共数据库分享;科研思路分享;
目录
相关文章推荐
蒲公英Ouryao  ·  6.6亿收购、药企实控人发生变化! ·  昨天  
E药经理人  ·  飙升50%!初代肺癌创新药王者,拐点之战打响 ·  3 天前  
医学影像沙龙  ·  尾部退化综合征 ·  3 天前  
51好读  ›  专栏  ›  生信百科

测序结果中的接头序列来自哪里?!

生信百科  · 公众号  · 医学  · 2017-07-20 05:01

正文

请到「今天看啥」查看全文


我们的测序结果中为什么含有接头序列呢?

从图1 A 中我们看到,在建库时把 DNA 随机打断为特定长度的片段,然后在每个片段的两端都连上了接头,新形成的测序片段可用图2简单表示:

图2 测序片段构成示例 (图片来自h ttp://nextgen.mgh.harvard.edu/CustomPrimer.html )

图中显示的是仅单端有 Index 的情况,如果 polling 的样品较多时,则双端均会有 Index;

如果建库时未用标准的试剂盒、barcode 位于插入片段开始或者结尾的话 (比如某些 GBS 文库),双端可能均没有 Index。

只有当插入片段的长度小于测序的读长 (PE125 中的 125 就是测序反应的读长) 时才会在测序结果中出现接头序列。 我们用一张图简单地介绍一下:







请到「今天看啥」查看全文