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往往整个转录组中许多基因通常是同时表达的，表达趋势一致。那么问题来了，什么基因倾向于共表达呢？为什么要共表达呢？如何找到趋势一致的基因呢？（看回顾中的聚类文章）。

共表达的基因往往共同调控一类代谢过程，或者被某些转录因子共调控，所以有些共表达的基因启动子区往往有共同的启动子。或者某些共表达的基因可以形成某个调控网络，来行使一定的功能！

所以，有意思了，怎么做共表达网络呢。很简单，其实就是看表达相关性！

如何计算相关性

方案一

来看数据（test.data）：

第一列是基因名称，从第二列开始都是不同的样品，这是测试数据

来看脚本，我这里恰巧有一个脚本来做这个数据：

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