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这中山大学博士生的14.7分Nature子刊,假设迭代做得就很好!看完这巨噬细胞和T细胞互作的文章,...

实验万事屋  · 公众号  · 科研  · 2025-05-06 20:20

主要观点总结

本文讲述了中山大学第一附属医院耳鼻喉科医院陈德猛团队在Nature子刊Nat Commun上发表的研究,关于抗CD276的抗体α-CD276耐药过程中巨噬细胞的浸润以及T细胞的耗竭。文章通过单细胞测序等技术分析了α-CD276用药后小鼠模型,发现了ITGB6可能与α-CD276耐药有关。研究通过假设迭代和科研推理,探讨了ITGB6在耐药过程中的作用以及其与巨噬细胞、T细胞之间的交互作用。

关键观点总结

关键观点1: 研究背景及目的

文章关注抗CD276的抗体α-CD276耐药过程中巨噬细胞的浸润以及T细胞的耗竭,探索肿瘤细胞、巨噬细胞与T细胞之间的Crosstalk。

关键观点2: 研究方法

研究使用单细胞测序技术分析了α-CD276用药后小鼠模型,通过差异基因分析、敲减实验和配体受体关联性分析等方法进行探讨。

关键观点3: 研究发现

研究发现ITGB6可能与α-CD276耐药相关,并涉及到巨噬细胞与T细胞之间的交互作用。通过敲除ITGB6,可以缓解小鼠HNSCC中的α-CD276耐药性,同时增加CD8+ T细胞的浸润。

关键观点4: 研究假设迭代

研究通过假设迭代,进一步探讨了ITGB6+肿瘤细胞与PF4+巨噬细胞之间的互作关系,以及这一互作对抗PD1抗体耐药性的影响。

关键观点5: 研究意义

该研究为理解抗CD276的抗体α-CD276耐药机制提供了新的见解,并为相关疾病的治疗提供了潜在的治疗靶点。


正文

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而进一步对PF4+ 巨噬细胞进行分析,他们发现PF4+ 巨噬细胞比例增多,则患者的存活率较低,同时CD8+ T细胞的浸润和杀伤能力会减弱:



ITGB6+肿瘤细胞与PF4+ 巨噬细胞之间的互作关系,是通过CX3CL1-CX3CR1这样的配体受体互作导致的。如果阻断了CX3CL1-CX3CR1这个轴可以抑制肿瘤细胞α-CD276耐药性的产生,那么ITGB6+肿瘤细胞与PF4+ 巨噬细胞之间的互作就是肿瘤细胞α-CD276耐药性的关键( 这就是一个充分条件的假言推理,在这个推理的过程中,必须要通过肯定前件或者否定后件,才能得到结果,在进行假言推理的过程中,认证仔细地分析是避免逻辑谬误的关键,不清楚的话,可以看看信号通路系列和科研逻辑系列 )。于是他们使用α-ITGB6、α-CX3CL1 和 α-CX3CR1阻断了CX3CL1-CX3CR1,而这样的确抑制了细胞α-CD276的耐药性,这里使用的就是肯地前件的推理,得到的结果就是ITGB6肿瘤细胞对α-CD276的耐药性,就是由CX3CL1-CX3CR1轴介导的:



那么PF4+ 巨噬细胞是否对肿瘤的微环境产生了什么影响呢?于是他们进一步分析单细胞测序结果中,可能与PF4+ 巨噬细胞有关的其他细胞的配体受体相关性。结果发现,ITGB6敲除的肿瘤中,PF4+ 巨噬细胞和 CD8+ T细胞之间,CXCL16-CXCR6相互作用显着减少,也就是说在ITGB6+ 肿瘤细胞刺激下,PF4+ 巨噬细胞可能是通过CXCL16-CXCR6轴,影响了CXCR6+T细胞:



而ITGB6敲除可以降低PF4+ 巨噬细胞中NFKB1的磷酸化( 这个其实就是NFκB信号通路中,入核的与p65结合的p50,这都是NFκB信号通路激活的关键转录因子,不熟悉NFκB信号通路的话,可以去看看《信号通路是什么鬼?》系列 ),他们发现p50能结合并启动CXCL16转录。而额外加入CXCL16,可以增加α-CD276耐药性。通过PF4+ 巨噬细胞和T细胞的共培养后发现,PF4+ 巨噬细胞与CD8+ T细胞的CXCL16-CXCR6轴,在低密度下可以刺激产生GZMB+CXCR6+CD8+ T细胞。而增加了PF4+ 巨噬细胞比例,也就是提高了CXCL16产生的浓度,则会使得GZMB+CXCR6+CD8+ T细胞转化为PD1+CXCR6+CD8+ T细胞,也就是说过度的PF4+ 巨噬细胞产生的CXCL16刺激,可以促进细胞毒性的CXCR6+CD8+ T细胞向抑制性的PD1+CXCR6+CD8+ T细胞的转变,抑制细胞毒性并诱导CXCR6+CD8+ T细胞耗竭:



既然ITGB6+肿瘤细胞互作的PF4+ 巨噬细胞,能通过CXCL16-CXCR6使得细胞毒性的CXCR6+CD8+ T细胞向抑制性的PD1+CXCR6+CD8+ T细胞的转变。于是他们又进行了假设的进一步迭代( 又是一个假设迭代,大家可以明显看出,这整篇文章就是在通过不断地分析新结果,反复进行假设迭代,才推导出来的,这个和科研套路所谓的方法学完全是两码事》 ),他们假设ITGB6+肿瘤细胞互作的PF4+ 巨噬细胞与抗PD1抗体的耐药也有一定的关联性。结果发现,ITGB6的确还促进了小鼠对α-PD1治疗的耐药性:



这篇文章很有意思,在逐步地递推过程中,迭代假设,又在得道进一步的结果后,推进课题。在每一个验证步骤中,他们也做到了相对的严谨,好了,今天就先策到这里吧,有兴趣的话,可以看看原文,祝你们心明眼亮。

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