专栏名称: 华大集团BGI
拥有世界一流的科研队伍,开展一系列重要动植物、人类健康、生物能源的基因组研究,致力于人类健康服务事业和科技应用领域的发展。
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华大植物时空组学研究成果获评WILEY高被引论文!

华大集团BGI  · 公众号  · 生物  · 2025-03-25 18:59

正文

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在这篇综述文章中,徐讯研究员团队基于多年来在植物时空组学领域的积累和探索, 从技术发展、技术优势和广泛应用等角度详细介绍并展望了空间转录组学在植物科学研究中面临的巨大机遇和潜在挑战



空间转录组学技术的发展


根据空间信息的获取方式不同,空间转录组学技术可分为三大类:基于激光捕获显微镜的方法(如LCM-seq,Geo-seq)、基于成像的方法(如FISSEQ、MERFISH等)、基于原位捕获测序的方法(如Seq-Scope、Stereo-seq等)。

在单细胞分辨率方面,目前能实现单细胞分辨率的原位捕获测序技术有Seq-Scope和Stereo-seq。这些技术能够推断亚细胞结构,并解决细胞异质性的问题。

在大视场方面,毫米范围内的微阵列限制了大规模组织的 ST 实验。Stereo-seq通过将芯片尺寸扩展至 13 x 13 cm,实现了厘米级的大视场。大尺寸切片可以完整地描绘大型组织的多个边缘和毗邻关系,为了解组织复杂性和单个切片内细胞的空间组成提供有价值的见解。

不同ST技术的特点比较








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