专栏名称: 基因检测与解读
介绍基因检测新进展,探讨基因数据分析流程与方法,分享罕见病故事,科普基因知识,个人基因检测报告解读
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讨论 | 二代测序报告中需要明确嵌合突变吗

基因检测与解读  · 公众号  · 科技自媒体  · 2017-07-13 06:58

主要观点总结

文章讨论了关于基因检测的报告内容,特别是关于TSC2基因的变异检测。文章提到了杂合子和嵌合突变的概念,以及它们在诊断中的影响。此外,文章还探讨了二代测序报告中嵌合突定的准确性和判断方法,并分享了对于突变reads占比的解释和个人判断经验。

关键观点总结

关键观点1: 杂合子与嵌合突变的诊断影响

杂合子和嵌合突变在诊断上大体不影响结果,但在疾病严重程度方面,嵌合体症状可能比杂合子轻。对于二胎产前诊断,两者有所不同。

关键观点2: 二代测序中嵌合突变的判断准确性

在常规二代测序中,判断嵌合突变的比例不是非常准确。要想准确获得嵌合比例,至少需要2000X的测序深度。

关键观点3: 突变reads占比的判断

突变reads占比在40%-60%之间波动,对于突变reads占比为30%时,可能是嵌合也可能是杂合,需要结合一代测序综合判断。个人经验是30%以下为嵌合的可能较大。


正文

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reads 比例为 14.41% ,从上面的一代峰图中我们也可以看到是低比例的嵌合。当然对于临床来说,还需要正反向测序以及父母的一代验证。

我们看到报告中是杂合子,而从二代结果与一代峰图结果好像是嵌合突变,那么问题来了,对于二代测序报告中需要明确嵌合突变吗?


在回答这个问题之前,我们先来看一下杂合子与嵌合突变影响患者的诊断结果吗?应该大体上说不影响诊断结果,影响疾病严重程度吗?从原理上来说,嵌合体症状应该会比杂合子轻一点,为啥呢,因为杂合子患病组织肯定







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