新出炉的Cytoscape视频教程

正文

请到「今天看啥」查看全文

文件，不能有 xls 后缀。

miRNA-mRNA调控网络

Cytoscape可用于绘制基因共表达网络，这儿选取miRNA-gene调控网络 (含miRNA-gene表达相关性数据)做为例子，涉及到根据表达变化倍数对每个点进行着色、根据表达相关性对线进行着色、miRNA和靶基因采用不同的形状表示、微调获得合适的展示图形、结果导出PDF格式、导出图例等。

不同的布局的调试和修改

网络绘制根据网络图的大小、展示的用意可以选择合适的布局。Cytoscape提供了多种布局算法，具体见http://manual.cytoscape.org/en/stable/Navigation_and_Layout.html。

下面列出几种示例

Attribute Circle Layout

属性环展示方式所有的节点都在环上，适用于点比较少的时候。环上点的顺序可以根据某一列来调整。

请到「今天看啥」查看全文