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出道即巅峰!Xenium空间组学国人文章首秀,荣登Cancer Cell封面

生信人  · 公众号  · 生物  · 2025-05-31 07:06

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1E),表明免疫被激活,但在ESCC阶段显著下降,提示免疫抑制环境形成。同时, 髓系细胞密度在 HGIN和ESCC阶段显著升高,可能指向其促肿瘤极化趋势

1 单细胞和空间原位组学揭示食管癌发生过程中的动态细胞群

2、增殖与侵袭性上皮细胞驱动ESCC演化

通过分析近 200万上皮细胞,研究团队识别出4类上皮亚群,并揭示其在ESCC发展中的动态演化(图2A–2E)。在正常组织中, 分化细胞占主导 ,而 LGIN阶段 增殖型上皮细胞显著扩张,伴随细胞周期、炎症与 DNA修复通路激活 (图 2B、2D)。


HGIN阶段, 侵袭性上皮细胞首次出现 ,表现出上皮 -间质转化(EMT)、血管生成和去分化特征(图2B、2C),并逐步突破上皮-间质界面形成“侵袭前沿”。ESCC阶段, 侵袭细胞占比升至 79.3%,完全侵入间质区 伴随分化细胞大幅减少(图 2C),提示其具推动癌变的核心能力。类器官实验证实,HGIN与ESCC具有显著增强的侵袭能力。

2 整个ESCC发育过程中上皮细胞的形态学和转录进化

3、去分化与侵袭性得分揭示癌变程度

研究团队基于上皮细胞演化轨迹,构建了 “上皮侵袭性得分”与“去分化得分” ,用于量化肿瘤进展状态(图 3A–3G)。通过TF-seqFISH与scRNA-seq数据分析发现, 这两个指标在 HGIN和ESCC阶段显著升高 (图 3C–3D),其中侵袭性细胞表现出最高的得分。


特别地, 去分化得分在增殖细胞中逐渐接近基底细胞水平 ,提示这是从前癌向恶性转化的关键转变(图 3E)。空间分布上, 高得分细胞由早期局限于基底层,逐步扩展至整个病变区域 (图 3F)。总体来看,这两个得分可作为ESCC进展的重要衡量指标(图3G)。

3 增殖细胞向去分化细胞的转化标志着食管鳞癌的进展

4、CAF-Epi生态位从HGIN阶段已初现雏形

研究显示,从 HGIN阶段开始,侵袭性上皮细胞即可激活邻近正常成纤维细胞转化为CAF(图4A–4E)。 CAF密度在HGIN显著上升,在ESCC中占主导 (图 4B),且其与上皮细胞的空间距离变远,提示其作用范围扩大(图4C)。


进一步的细胞邻域分析识别出 CAF与侵袭性上皮细胞共构的“CAF-Epi生态位”,出现在HGIN的侵袭前沿和ESCC的肿瘤边缘 (图 4F–4I),且CAF活性增强。在头颈鳞癌中也观察到类似结构(图4J), 提示这一生态位可能是鳞癌进展的共同特征

4 由侵袭性上皮细胞和附近的CAF在HGIN和ESCC阶段形成的CAF-Epi生态位

5、JAG1-NOTCH1 信号驱动CAF-Epi生态位形成

作者发现, 侵袭性上皮细胞通过 JAG1-NOTCH1信号激活CAF形成CAF-Epi生态位







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