专栏名称: 测序中国
测序中国(seq.cn):基因行业新媒体
目录
相关文章推荐
51好读  ›  专栏  ›  测序中国

NGS接龙丨Paragon Genomics CEO谌涛:选择正确的方向,做自己擅长的事

测序中国  · 公众号  ·  · 2017-08-30 13:11

正文

请到「今天看啥」查看全文


文库制备:告别“石器时代”

目前,随着技术进步以及政策的推进,精准医学正在从科研和创投领域的热门概念变成惠及大众的医疗模式。谌涛向测序中国记者介绍道, 如果说测序其实已经进入了现代化的21世纪,那么测序前的文库制备可以说还停留在石器时代。

Paragon Genomics即是一家致力于突破目前基因检测领域靶向测序准确度及覆盖率低、成本高及时间长等瓶颈的生命科技公司。 据了解,公司开发的超高多重PCR生物试剂平台技术 CleanPlex™ ,已于2016年10月获得专利,其二代测序靶向基因文库制备的速度比市场上现有方法快5~10倍,并且更为灵敏且准确。

谌涛向测序中国介绍道,Paragon Genomics公司的核心技术CleanPlex™操作便捷, 可以将建库时间缩短至2.5小时,已基本达到目前行业的最高技术水平 ;此外,CleanPlex™拥有高效的PCR背景清除技术,可以去除多重PCR的非特异性产物,在测序的时节省很多资源,使得一些无用的“垃圾”序列不再被测出;另外,这一技术所需要的样本量也很少,甚至可以低至0.1纳克。他还透露,针于液态活检方面,Paragon Genomics目前正在研发并加入分子条码的技术,将来的检测敏感度能够做到千分之一甚至以下。

CleanPlex™靶向建库流程

谌涛表示, Paragon Genomics相当于一个B2B商务平台 ,“ 我们为很多客户提供的是定制的服务 ,客户会确认需要扩增的位点,将靶向测序的清单提供给我们,进而根据这个清单设计引物,引物的数量可能达到几千对甚至更多。此外,我们可以同时使用几十至上百台机器在云端进行计算,最后将信息进行整合,将完美的报告呈现给客户。”

Paragon Genomics创办至今已有两年,公司目前已拥有了斯坦福大学、美国加州大学旧金山分校及多家大型第三方检验实验室等诸多重量级客户。 USDA-ARS太平洋盆地农业研究中心的Scott Geib博士 曾表示:“CleanPlex™技术让我们能够使用少量并且质量受损的样本。CleanPlex流程简易,速度快,产品价格也合理。对我们来说,能够在一个反应管里成功做到高达800重的PCR反应,这简直就是魔法!”

谌涛也透露,除了积极发展国外的市场,目前Paragon Genomics也在努力拓宽国内的市场道路。作为公司的重要客户, 安诺优达首席执行官陈重建博士 对Paragon Genomics作出了高度评价:“Paragon Genomics面板设计团队在短时间内为我们设计了一个高质量的定制面板,我们使用CleanPlex™靶向测序文库制备试剂盒进行建库,流程简单易用,扩增均一性和上靶率高。我们对产品性能及公司提供的技术支持非常满意。”

从全基因测序时代 迈向靶向测序时代

转眼间,谌涛已经涉足健康领域近20年,已成了一位不折不扣的“老兵”,NGS技术也经历十年的发展历程。在谈及NGS的下一个十年时, 谌涛希望这一技术可以走进千家万户,但这个过程还需“做减法” 。他解释道,基因市场的核心是人类的全基因组信息,基于此从业者可以创造出丰富产品,衍生出多种多样的服务。 他认为,将来基因领域的主战场就包括靶向测序,在临床上甚至农业领域,靶向测序会占据愈发重要的地位,甚至可能大过全基因组市场。







请到「今天看啥」查看全文