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首张拓扑异构酶II全基因组剪切图谱

生物通  · 公众号  ·  · 2017-07-10 11:27

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医生研究学者和RNA生物学家联手创建了一个新的DNA测序工具,可识别人类白血病细胞整条基因组上TOP2特定剪切位点,“该项工具为更好地理解和最终操控TOP2剪切,预防白血病异常重排开辟了新可能。”本研究共同领导人Carolyn A. Felix医学博士说。


在过去几年里,Felix团队一直与宾夕法尼亚大学的生物学家Brian D. Gregory领导的一个小组合作。利用全基因组测序技术,对所有DNA、RNA结合结合蛋白进行编目。“我们设计了一个pull down方案,将与TOP2结合的所有DNA从基因组内拽出来,然后把蛋白质和DNA分离,在单碱基对水平上对被剪切的DNA测序,”Gregory博士说。“通过这项工作,我们首次在全基因组尺度绘制了拓扑异构酶剪切位点图谱。”








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