正文
为满足单细胞测序的多样化应用场景需求，
因美纳推出的
ISCP
对
人类、小鼠等
物种的不同样本类型具有良好的普适性，
扩大了单细胞测序的覆盖范围以及癌症各样本类型的可用性
，可为癌症研究提供更精细、更全面的生物信息。
例如，加
州大学旧金山分校
研究团队
使用
ISCP
分析
了
混合表型急性白血病
的血液
样本
[3]
，
以
检测化疗耐药
细胞
亚群的
异质性，
揭示了标准免疫分型无法检测到的
细胞亚群
特征
。
图：
白血病患者的临床流式细胞
分析
和相应
PIPseq
抗体衍生标签
分析
。
[3]
由于样本保存、运输方面的挑战以及样本类型、批次效应的限制，利用新鲜样本进行癌症单细胞测序并不总是容易实现
，
为核酸提取和测序带来了挑战。随着技术的进步，目前已经可以
对
新鲜
样本进行
DSP-
甲醇固定
，用于后续
单细胞分析
，这可以
进一步丰富单细胞测序的应用场景，提高临床癌症样本的利用率。
单细胞测序能够
准确解析
样本的
细胞组成
以及
容易
被
忽略
的、脆弱
关键细胞
亚型，这些
罕见或独特的细胞亚型可能在癌症中发挥重要作用。
胰腺癌作为癌症之王，不仅生存率低，其样本
活性
同样很低，从人体中取出后会自动消化，因此
胰腺癌样本
的
保存和解离是单细胞测序领域的重要难题之一
。王红霞等
研究人员
利用
单细胞
RNA
测序，首次系统解析了胰腺导管腺癌微环境中癌症相关成纤维细胞（
CAF
）的分子全景及其异质性亚型
[4]
。但该研究中
CAF
亚型的细胞数量相对较少，这可能导致统计效力不足。
对于富有
挑战性
的
样本，样本制备过程的优化会影响数据质量
。
2022
年，
张宁
等
研究人员
首次在单细胞水平全面揭示了肝癌
的免疫微环境亚型和中性粒
细胞
异质性
等
[5]
。由于
中性粒细胞非常脆弱，在体外环境很容易死亡，
该研究利用优化的
快速实验流程，成功捕获到
3
万多个
脆弱的
中性粒细胞，并鉴定
出
6
个
肿瘤相关中性粒细胞
亚群，为肝癌的基础研究和临床诊疗提供了关键信息。
图：胰腺导管腺癌和正常胰腺组织中所有细胞的单细胞图谱。
[4]
快速样本制备有助于保持样本的完整性，以提高靶标细胞的捕获效率
。
