正文
),通过质谱验证发现MRPL12与UBASH3B之间存在相互作用。接着,他们进一步对UBASH3B进行缺失突变,结果发现缺乏SH3结构域的UBASH3B,不能与MRPL12相互作用,也就是说UBASH3B通过其SH3结构域,在特定相互作用中成为MRPL12的伴侣:
那么UBASH3B与MRPL12的结合,又是怎么影响线粒体功能的呢?首先他们敲减了UBASH3B,确定了UBASH3B本身也可以影响线粒体的功能。就UBASH3B本身而言,它具有酪氨酸蛋白磷酸酶活性(可以对磷酸化的氨基酸残基,去磷酸化)。根据这些信息,他们假设UBASH3B可能会影响MRPL12的磷酸化修饰水平。MRPL12有两个磷酸化位点Y60和Y152残基,而UBASH3B的H391残基则是其酪氨酸磷酸酶活性残基。他们并没有简单地仅凭直接敲减UBASH3B来确定其功能,而是通过分别进行了MRPL12的Y60A和Y152A突变,以及UBASH3B的H391A突变,通过分别将残基突变成丙氨酸,使其功能失活,以此来分析具体的功能与表型之间的联系(
这就相当于他们将原有的UBASH3B与MRPL12的表达与线粒体功能的关系这样的命题,缩小了外延,变成了UBASH3B与MRPL12的互作功能,影响了MRPL12的磷酸化,导致了最终的线粒体表型,这样就避免了肯定后件的逻辑谬误,不清楚命题、外延和肯定后件逻辑谬误的话,可以看看《科研的推理和逻辑》、《列文虎克读文献》和《信号通路是什么鬼?》系列
)。结果显示UBASH3B通过其酪氨酸磷酸酶活性,调节MRPL12的Y60残基的磷酸化,通过线粒体激活,促进了LUAD的发展:
MRPL12的Y60残基磷酸化水平,与其功能作用之间存在直接关联,那么MRPL12的Y60残基磷酸化水平又是怎么样影响线粒体具体功能的呢?他们发现MRPL12的Y60残基磷酸化水平,可能与线粒体的发生及生物合成有密切关系。那线粒体生物合成的关键,就是mtDNA上转录增强,而文献显示MRPL12可以直接结合并激活POLRMT(线粒体 RNA 聚合酶),从而调节线粒体生物合成。而通过对MRPL12的Y60A突变,他们发现MRPL12的Y60A突变,减弱了内源性MRPL12和POLRMT之间的互作。而UBASH3B的表达增强,也能阻遏MRPL12和POLRMT之间的互作。也就是说,UBASH3B很可能是通过介导MRPL12的Y60残基去磷酸化,选择性抑制了MRPL12与POLMT的结合,从而导致线粒体功能障碍和LUAD恶性表型受到抑制:
最后他们进行了MRPL12的Y60A突变的体内验证,确定了MRPL12的Y60残基去磷酸化,可以抑制肿瘤形成、转移,以及类器官形成:
最后就形成了这样的示意图,UBASH3B可以通过SH3结构域,与MRPL12的特异性结合,使MRPL12中的Y60残基去磷酸化。MRPL12的Y60残基磷酸化水平的降低,阻碍了MRPL12与POLMT的结合,下调了LUAD细胞中的线粒体代谢,会抑制肿瘤的进展:
这篇文章推进的过程就非常有意思,从一个线粒体相关的基因,一步步推断出其功能,通过与其互作的蛋白,分析出造成功能的原因,这都是假设迭代的结果。同时他们并没有从表达的角度来分析MRPL12造成的影响,而是精准地找到了MRPL12的具体功能相关的氨基酸残基,并进行了突变(
这就有效地避免了肯定后件的逻辑谬误,使得这个课题相对来说更为严谨
)。好了,今天就先策到这里吧,有兴趣的话可以看看原文,祝你们心明眼亮。
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