正文
已知PRC1复合体能够催化H2A泛素化,将复合物组成蛋白Ring1B敲除后,H2Aub水平会相应降低。ChIP测序发现RSF1能够结合在H2A泛素化的位点处,而Ring1B敲除会抑制RSF1对染色体的结合(Fig.2F)。统计发现,RSF1能够识别和结合高达82%的H2Aub区域,包括HOX家族基因簇等等,暗示H2Aub的功能与RSF1的结合紧密联系(Fig.2G);然而RSF1识别位点却不仅仅限于泛素化的组蛋白区域(21%),说明其功能并不仅仅限于H2Aub调控的基因沉默(Fig.2G)。
Fig.1 RSF1蛋白可以结合H2Aub泛素化修饰的核小体
Fig.2 RSF1上新鉴定出的UAB结构域负责结合核小体
RSF1和RNF2/Ring1B都能影响H2Aub下游基因的表达
为了研究RSF1与组蛋白泛素化之间的功能,研究者进一步构建了多株突变细胞:
HeLa细胞系中分别进行:
1:RSF1 KD
2:直接影响H2Aub水平的:RNF2 KD(Ring1B的人源同源蛋白)和SNF2H KD
分析突变后的差异基因发现,RNF2 KD中共计26+36个基因表达有变化,而RSF1 KD中共计72+36个基因表达出现变化,也就是说这其中的36个交集差异基因是同时被RNF2和RSF1共同调控的;类似的差异也同样存在于SNF2H KD中(Fig.3A)。
小鼠ESCs中分别进行:
1:RSF1 KO
2:直接影响H2Aub水平的:Ring1B KO,并且发现只会影响H2Aub,不会影响RSF1蛋白水平。
分析差异基因发现,Ring1B KO和RSF1 KO含有232个共同差异基因(Fig.3B)。
以上共同差异基因中包含大量的组蛋白泛素化调控基因,比如Hox家族基因,能够被PRC1复合物影响的H2Aub水平调控;在Ring1B KO和RSF1 KO细胞中都发现其表达水平上升(Fig.3C-E)。
通过体外转录体系,研究者证明了RSF1的加入能够直接抑制包含H2Aub修饰的染色体转录活性(Fig.4)。
Fig.3 RSF1和RNF2突变细胞表达变化
Fig.4 体外转录证明RSF1抑制H2Aub修饰染色体的基因转录