单细胞测序中，细胞群的下游机制都做烂了，但上游的这三个思路还新着呢！

小张聊科研 · 公众号 · 科研 · 2025-06-08 14:58

主要观点总结

文章主要讨论了单细胞测序分析中，如何基于细胞比例挑选在疾病组或干预组发生变化的细胞群，并以A+巨噬细胞为例，探讨了其在疾病中的促进角色以及药物对其的抑制作用。文章还详细阐述了A+巨噬细胞在疾病组织中比例升高的原因，包括产生增多、消耗减少以及从其他地方被招募过来。此外，文章提出了缺氧作为病理因素在A+细胞群中的作用，并讨论了研究的可能创新点和课题名称。

关键观点总结

关键观点1: 单细胞测序分析中的细胞群挑选方法

基于细胞比例挑选在疾病组或干预组发生变化的细胞群是常规分析，如A+巨噬细胞在疾病组比例显著高于对照组织。

关键观点2: A+巨噬细胞在疾病中的作用及药物影响

A+巨噬细胞在疾病中起促进作用，药物可抑制其比例。研究重点是探索A+巨噬细胞如何促进疾病进展以及药物如何抑制它。

关键观点3: A+巨噬细胞在疾病组织中比例升高的原因

A+巨噬细胞在疾病组织中比例升高的原因包括产生增多、消耗减少以及从其他地方被招募过来。其中，产生的多可能源于细胞增殖或分化增多，消耗的少可能由于细胞死亡或分化成其他细胞。

关键观点4: 缺氧对A+细胞群的影响

缺氧作为疾病的病理因素，可在A+细胞群中通过诱导B基因表达导致A+细胞群抵抗程序性死亡，从而导致其比例增加。HIF1 α抑制剂可导致A+细胞群程序性死亡并改善疾病进展。

正文

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1. A+ 巨噬细胞是如何促进疾病进展的？

2. 药物是如何抑制 A+ 巨噬细胞的？

对 A+ 巨噬细胞来说，一个是下游机制，一个上游原因。 从这个角度来说，是不是与基因和分子的逻辑很像？比如我们发现基因 A 在疾病中高表达，在研究 A 基因如何促进疾病的下游机制后，是否还会考虑基因 A 高表达的原因？比如考虑基因 A 被转录激活、翻译活化、或者蛋白稳定性增加等等？