主要观点总结
本文描述了一篇关于中国医科大学盛京医院博士生发表在Nature子刊Nat Commun上的研究,该文章探讨了骨肉瘤与CD8⁺T细胞之间的互作联动。文章通过不同的组学分析,包括16s rRNA测序和代谢组学,找出与多发性骨髓瘤(MM)相关的微生物和代谢产物。文章还探讨了PC(磷脂酰胆碱)及其衍生物LPA在MM细胞与CD8⁺T细胞相互作用中的影响,并揭示了SerpinB9在其中的作用。机制研究表明,PC产生LPA,LPA影响SerpinB9的产生,SerpinB9通过外泌体进入CD8⁺T细胞,并通过抑制TP53的表达影响GMZB的产生。文章涉及复杂的信号通路和机制,对科研的推理和逻辑要求较高。
关键观点总结
关键观点1: 文章的研究焦点
探讨骨肉瘤与CD8⁺T细胞之间的互作联动,通过不同的组学分析找出与MM相关的微生物和代谢产物。
关键观点2: 关键实验过程
采用16s rRNA测序和代谢组学分析,发现瘤胃球菌科和毛螺菌科在MM中比例变化,并探索PC、LPA、SerpinB9在MM细胞和CD8⁺T细胞互作中的影响。
关键观点3: 重要发现
PC产生LPA,LPA影响SerpinB9的产生,SerpinB9通过外泌体进入CD8⁺T细胞并影响TP53的表达,进而调节GMZB的产生,揭示了一个复杂的信号通路。
关键观点4: 文章机制研究的复杂性
涉及多个信号通路和复杂的机制,对科研的推理和逻辑要求较高,包括假设迭代、归纳法、柯霍氏法则等科研方法的应用。
正文
接着他们分析了SerpinB9在CD8⁺T细胞中,对于GMZB的表达所产生的影响,他们发现TP53能结合GMZB的启动子,而SerpinB9会抑制TP53的表达。在敲减了TP53之后,CD8⁺T细胞中GMZB的表达也受到了影响(
TP53是常见的抑癌基因了,其实也就是p53信号通路中的关键转录因子,在这里他们分析的是敲减了TP53后对于下游GMZB的表达影响,实际上这个对于验证SerpinB9通过TP53影响下游GMZB转录来说,是存在逻辑漏洞的,也就是所谓的肯定后件逻辑谬误,不清楚的话,可以去看看《信号通路是什么鬼?》系列和《科研的推理和逻辑》
)。为了进一步说明SerpinB9对TP53的影响,他们分析了TP53的UFMylation, UFMylation可通过拮抗泛素化提高TP53稳定性。而SerpinB9通过与UFC1(泛素折叠修饰物结合酶1)的竞争性结合,阻碍了TP53与UFC1的结合,从而抑制了TP53的UFMylation(说实话,这个机制真的是好复杂,看到这里,我想问问你们是不是还记得啥是毛螺菌):
最后他们就用体内实验,验证了PC对于MM的TME(肿瘤微环境)中对CD8⁺T细胞的抑制。形成的这个机制图就特别复杂(
这个是夏老师随便用PPT画的,不知道怎么画的话,可以去看看《夏老师带你读文献》复习下
),毛螺菌抑制MM产生PC,而PC通过在MM细胞内形成脂质衍生物LPA,影响了LIN28 A/B对SerpinB9的pre-mRNA的剪接,促进了SerpinB9的产生。而SerpinB9通过外泌体分泌到TME中,被CD8⁺T细胞摄取,SerpinB9进入CD8⁺T细胞后,通过结合UFC1抑制了TP53的UFMylation,从而降低了TP53的表达,导致了TP53无法转录产生GMZB这样的细胞毒性分子来抑制MM进展:
这篇文章的机制研究工作量是比较大的,但是有几个节点其实还是不够明确,比如LPA是如何影响LIN28 A/B的?毛螺菌是如何抑制PC产生的?为什么突然会想到通过TP53的UFMylation这个途径来分析SerpinB9对于TP53的影响?整个链条看上去是挺长的,但如果能更深入把这些细节都挖掘好,其实会更有意思。好了,今天就先策到这里吧,有兴趣的话可以看看原文,祝你们心明眼亮。
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本文为夏老师个人观点,仅讨论文章本身,对超出文章以外的内容并不多做评价,如有异意,欢迎在评论区讨论
)
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