中国学者在Nature Methods发表论文，介绍三代测序数据计算方法的突破

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给数据分析了巨大的挑战，严重影响了三代测序技术的应用。 为此我们提出了一种全新的基于全局投票打分的候选序列评估方法，该方法可以大幅降三代序列比对、校正和组装的计算资源消耗，从而极大提高计算效率；并基于此方法成功开发了集序列比对、校正和组装为一体的三代测序分析软件MECAT。 与同类软件相比，MECAT在计算速度上表现出了明显的优势，并且首次在单个服务器上实现了中国人的基因组组装工作；为加速三代测序技术在生物和医学的应用提供了重要的支撑。

图1 三代测序数据的基因组组装时间对比

基于三代测序数据的基因组组装中最消耗计算时间的过程是序列局部比对。为了减少进入局部序列比对的候选区域，研究人员提出快速测量两个序列编辑距离的序列差异因子 （DDF）

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